Museômica dos ratos de bamboo do gênero Dactylomys (Rodentia: Echimyidae)

• Processo: 22/03267-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Mestrado
• Vigência (Início): 03 de outubro de 2022
• Vigência (Término): 02 de abril de 2023
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Zoologia - Taxonomia dos Grupos Recentes
• Pesquisador responsável: Alexandre Reis Percequillo
• Beneficiário: Heitor Bissoli Silva
• Supervisor: Fabre Pierre-Henri
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Local de pesquisa: Institut des Sciences de l'Évolution de Montpellier (ISEM), França
• Vinculado à bolsa: 21/00159-6 - Diversificação dos ratos-do-bambu do gênero Dactylomys I. Geoffroy, 1838 (Rodentia: Echimyidae): uma abordagem filogenômica e ecomorfológica, BP.MS
• Assunto(s): Genômica Filogenia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Amazon | exon-capture | Genomics | Natural History Collections | Phylogenetics | Filogenômica

Resumo

Os ratos bambus do gênero Dactylomys são equimideos arborícolas (Rodentia: Echimyidae) que habitam a região amazônica e arredores, comumente encontrados perto de cursos d'água, associados à vegetação das terras baixas. Métodos genômicos avançados foram a principal fonte para testar a sistemática da família na última década, entretanto, alguns gêneros como os Dactylomys ainda são negligenciados, provavelmente devido à dificuldade de localizá-los e coletá-los, bem como sua disponibilidade dispersa por coleções nacionais de mamíferos. Baseado principalmente nas evidências morfológicas e moleculares disponíveis, o gênero é dividido em 3 espécies: D. peruanus, D. boliviensis e D. dactylinus. As variações morfológicas, geográficas e genéticas foram previamente identificadas entre estas espécies, embora poucos estudos tenham sido implementados. Neste contexto, espécimes em museus e coleções biológicas tornam-se material essencial para acessar o conhecimento sobre a diversidade de suas espécies e biogeografia. Esta proposta visa aplicar métodos museômicos recentes de DNA antigo para sequenciar amostras de espécimes de Dactylomys (Rodentia: Echimyidae) de uma ampla abrangência geográfica e taxonômica depositados em coleções de história natural. Iremos sequenciar tanto mitogenomas quanto 500 genes nucleares para inferir a primeira árvore filogenômica para o gênero e testar a delimitação e o número de espécies usando uma ampla gama de métodos. O Sequenciamento de Nova Geração para recuperação de genoma nuclear e mitogenoma será realizada em um centro de referência de pesquisa evolutiva Institut des Sciences de l'Évolution de Montpellier (França) supervisionado pelo Dr. Pierre-Henri Fabre. As análises filogenéticas serão conduzidas utilizando critérios de otimização distintos. Utilizando abordagens de datação molecular Bayesiana e uma ampla gama de registros fósseis, dataremos os eventos de especiação entre as espécies de Dactylomys a fim de discutir a história biogeográfica e a história de diversificação do clado de ratos-do-bambu nos Neotrópicos. (AU)