Integrando citogenética e genômica: evolução dos sistemas de cromossomos sexuais em espécies de Harttia (Siluriformes, Loricariidae)

• Processo: 22/04261-2
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Data de Início da vigência: 20 de dezembro de 2022
• Data de Término da vigência: 19 de junho de 2023
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: Marcelo de Bello Cioffi
• Beneficiário: Francisco de Menezes Cavalcante Sassi
• Supervisor: Thomas Liehr
• Instituição Sede: Centro de Ciências Biológicas e da Saúde (CCBS). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). São Carlos , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Friedrich Schiller University Jena, Alemanha
• Vinculado à bolsa: 20/02681-9 - Relações evolutivas e história demográfica em espécies de Loricariidae (Siluriformes), com ênfase no gênero Harttia, BP.DR
• Assunto(s): Citogenética Genômica Cromossomos sexuais Peixes Pintura cromossômica Sequenciamento NGS Loricariidae
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cromossomos sexuais | DNAs satélites | Peixes | Pintura cromossômica | Sequenciamento NGS | Citogenética Animal

Resumo

O aluno desenvolveu 24 meses do projeto intitulado "Relações evolutivas e história demográfica em espécies de Loricariidae (Siluriformes), com ênfase no gênero Harttia" (FAPESP 2020/02681-9), e os resultados alcançados até o momento foram publicados nas revistas Genes (IF=4,096) e Biology (IF=5,079), com o aluno figurando como primeiro autor. Até agora, foram realizados procedimentos de citogenética convencional e molecular (mapeamento cromossômico de famílias multigênicas e algumas repetições de microssatélites, hibridização genômica comparativa (CGH), permitindo a descrição de dois sistemas de cromossomos sexuais em três espécies distintas de Harttia. Assim, considerando o bom andamento do projeto e o envolvimento do aluno em outros experimentos de laboratório, pretendemos nos aprofundar em abordagens citogenômicas moleculares modernas, incluindo o isolamento e caracterização de uma biblioteca de DNA satélites, microdissecção de cromossomos para experimentos de pintura cromossômica, e investigações de hibridização in situ de fluorescência multicolor (m-FISH). Esses resultados contribuirão para uma melhor compreensão dos processos evolutivos que moldam a distribuição atual dos cromossomos sexuais entre as espécies de Harttia e, consequentemente, para a compreensão da evolução do genoma dos peixes. Os experimentos serão realizados no laboratório do Molekulare Zytogenetik (Universitätsklinikum Jena - Alemanha), chefiado pelo Prof. Dr. Thomas Liehr, pesquisador de relevância mundial em microdissecção cromossômica e FISH. Além dos avanços científicos esperados, esta proposta proporcionará uma oportunidade única para a formação científica do aluno, interagindo com um renomado grupo de pesquisadores alemães e aprendendo novas metodologias de estudo atualmente empregadas no laboratório Dr. Liehr. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

SASSI, FRANCISCO DE MENEZES CAVALCANTE; DEON, GEIZE APARECIDA; SEMBER, ALEXANDR; LIEHR, THOMAS; OYAKAWA, OSVALDO TAKESHI; MOREIRA FILHO, ORLANDO; BERTOLLO, LUIZ ANTONIO CARLOS; VICARI, MARCELO RICARDO; CIOFFI, MARCELO DE BELLO. Turnover of multiple sex chromosomes in Harttia catfish (Siluriformes, Loricariidae): a glimpse from whole chromosome painting. FRONTIERS IN GENETICS, v. 14, p. 8-pg., 2023-07-28. (20/02681-9, 20/11772-8, 22/04261-2)