A família de fatores de transcrição GRF em espécies de Coffea spp.: genômica comparativa e aspectos evolutivos

• Processo: 22/03819-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2022
• Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2023
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
• Pesquisador responsável: Douglas Silva Domingues
• Beneficiário: Thalita Pinheiro Resende
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Rio Claro. Rio Claro , SP, Brasil
• Assunto(s): Genômica comparativa Árvore filogenética Coffea Fatores de transcrição Análise de sequência de RNA Estudo comparativo
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Coffea | Evolução | fatores de transcrição | Genômica de poliplóides | Grf | relações filogenéticas | Genomica Vegetal e Evolução

Resumo

Os Growth Regulating Factors (GRF) constituem uma família gênica de fatores de transcrição exclusivos de plantas, fundamentais para a regulação do crescimento e desenvolvimento. Atuam no desenvolvimento de flores, sementes e raízes, bem como na coordenação do crescimento frente a interações hormonais e de estresse. Em termos pós-transcricionais, podem ser regulados por uma família de microRNAs, bem como por proteínas co-ativadoras. A família GRF foi caracterizada em diversas espécies de plantas, desde espécies basais até angiospermas. Análises comparativas preliminares de bancos de dados públicos sugerem uma perda de membros da família GRF no evento que gerou a espécie alotetraploide Coffea arabica, o que torna esta família gênica um importante estudo de caso de evolução genômica em Coffea spp, com desdobramentos básicos e biotecnológicos. O presente projeto tem por objetivo avaliar parâmetros evolutivos e transcricionais dessa família de fatores de transcrição. Para isso, realizaremos análises filogenéticas, de sintenia, de duplicação gênica, além de re-análise de dados públicos de RNA-seq para selecionar genes candidatos à validação transcricional por RT-qPCR. O presente estudo contribui para compreender a dinâmica da evolução de famílias gênicas em uma espécie vegetal poliploide, buscando compreender a complexidade e diversidade da origem dos mecanismos moleculares na origem das novidades evolutivas em plantas, bem como trazendo subsídios para aplicações biotecnológicas envolvendo o uso desta família gênica em cafeeiro.(AU)