Bolsa 22/06218-7 - Aspergillus fumigatus, Inteligência artificial - BV FAPESP
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Extração de Informações Biológicas de redes a partir de medidas topológicas

Processo: 22/06218-7
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Mestrado
Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2022
Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2023
Área de conhecimento:Interdisciplinar
Pesquisador responsável:Odemir Martinez Bruno
Beneficiário:João Paulo Cassucci dos Santos
Instituição Sede: Instituto de Física de São Carlos (IFSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:18/22214-6 - Rumo à convergência de tecnologias: de sensores e biossensores à visualização de informação e aprendizado de máquina para análise de dados em diagnóstico clínico, AP.TEM
Assunto(s):Aspergillus fumigatus   Inteligência artificial   Redes biológicas
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Aspergillus fumigatus | Inteligência Artificial | Redes Biológicas | Ciência de Redes voltada para Biologia

Resumo

Este projeto tem como objetivo utilizar-se de redes metabólicas montadas a partir de experimentos de expressão genética de modo a obter possíveis vias metabólicas diferencialmente expressas com o intuito de melhor compreender o funcionamento do metabolismo do fungo Aspergillus fumigatus que tem adquirido resistência a fungicidas como Caspofungin. A montagem dos grafos se utilizará de algoritmos já descritos na literatura como válidos para a obtenção de vias metabólicas nos fungos. Será buscado padrões topológicos nestas redes que nos permita compreendê-las e classificá-las de acordo com suas funções biológicas.

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Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
SANTOS, João Paulo Cassucci dos. Biologia de sistemas e aprendizagem de máquina: novas aplicações de métodos computacionais. 2024. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Física de São Carlos (IFSC/BT) São Carlos.

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