Mapeamento de assinaturas epigenômicas de células tronco de gliomas

• Processo: 22/11918-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Vigência (Início): 01 de outubro de 2022
• Vigência (Término): 30 de abril de 2023
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
• Pesquisador responsável: Tathiane Maistro Malta Pereira
• Beneficiário: Felipe Pimenta Carcanholo
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 18/00583-0 - Análise epigenômica integrativa de gliomas: definindo regiões regulatórias associadas ao stemness e ao fenótipo hipermetilador de tumores com mutações nos genes IDH1/2, AP.JP
• Assunto(s): Biologia computacional Aprendizado computacional Células-tronco neurais Metilação de DNA Glioma Epigenômica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Aprendizado de Máquina | Epigenômica | glioma | metilação de DNA | stemness | Bioinformática

Resumo

Este pesquisador trabalhará na identificação de assinaturas de células-tronco neurais em amostras de glioma. Para isso serão utilizados dados públicos e ferramentas R/biocondutor de código aberto para mapear assinaturas de células-tronco neurais não tumorais que podem ser usadas para medir o estado de desdiferenciação (ou Stemness) de amostras de glioma em relação à sua célula de origem. Será definida uma assinatura de metilação de DNA de células-tronco neurais e utilizando esta assinatura será construído um modelo de predição de Stemness usando dados de metilação de DNA. Em seguida o modelo de predição será aplicado em amostras de glioma do banco de dado público Atlas do Genoma do Câncer (TCGA) para a quantificação do Stemness nos tumores. A identificação de amostras de glioma com assinaturas de células-tronco contribuirá para o entendimento da gliomagênese e célula de origem.(AU)