Caracterização longitudinal dos mecanismos imunorreguladores e proteção do hospedeiro na infecção pelo vírus da dengue

• Processo: 22/08116-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2022
• Data de Término da vigência: 31 de outubro de 2023
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Imunologia
• Pesquisador responsável: Otávio Cabral Marques
• Beneficiário: Desirée Rodrigues Plaça
• Supervisor: Shirit Einav
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Stanford University, Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 20/11710-2 - Análise sistêmica e integrativa dos mecanismos de exaustão dos linfócitos T de pacientes com Dengue, BP.DD
• Assunto(s): Vírus da dengue Dengue Estudos longitudinais Imunorregulação Interações entre hospedeiro e microrganismos Transcriptômica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Dengue Vírus | Immunoregulation | Integrative | Longitudinal | systems | Transcriptomics | Imunologia Sistêmica

Resumo

A dengue é um problema de saúde global que afeta aproximadamente 390 milhões de pessoas por ano, em mais de 120 países, mas nenhuma terapia ou vacina específica está atualmente disponível para combater efetivamente a infecção pelo vírus da dengue (DENV). Enquanto a maioria dos indivíduos infectados pelo DENV são assintomáticos ou apresentam sintomas não complicados, 5-20% dos pacientes desenvolvem dengue grave (SD) em vários dias, com manifestações da doença com risco de vida devido a mecanismos ainda pouco compreendidos. Atualmente, não há biomarcadores clinicamente utilizáveis para prever quem progredirá para SD e não há tratamento aprovado ou vacinas seguras para prevenir a SD. Assim, há uma necessidade urgente de compreender de forma abrangente a resposta imune anti-DENV. Recentemente, caracterizamos a sobreposição entre a infecção natural pelo DENV e os ensaios de vacinas, identificando marcadores candidatos para monitorar a eficácia da vacina contra o DENV e mostramos o cenário da exaustão das células T em associação com a gravidade da doença. Em paralelo, o laboratório Einav coletou amostras longitudinais de PBMC e soro de mais de 500 pacientes infectados por DENV e desenvolveu uma nova abordagem transcriptômica de célula única incluindo vírus (viscRNA-seq) para monitorar a resposta do hospedeiro à infecção por DENV em correlação com a abundância viral em amostras de pacientes com dengue. Esta análise revelou determinantes moleculares envolvendo células T reguladoras e exauridas que estão associadas à progressão da SD. Dada a sobreposição no interesse de nossos grupos em desvendar a fisiopatologia da SD, na proposta do BEPE meu objetivo é elucidar o papel das células T reguladoras e exauridas na patogênese da SD, usando abordagens complementares desenvolvidas no laboratório Einav. Minha hipótese é que alterações na abundância, perfil de expressão e exaustão imunológica de subconjuntos de células T, bem como o tempo e a magnitude de suas respostas, desempenham um papel no aumento da gravidade da doença em humanos e podem ser usados como alvos candidatos para prognóstico e tratamento. No Objetivo 1, vou monitorar a cinética da abundância de subconjuntos de células alteradas e perfis de expressão de RNA e proteínas identificados em subconjuntos de células T em pacientes que evoluíram para SD durante o curso da doença usando abordagens transcriptômicas e proteômicas de célula única. No Objetivo 2, caracterizarei funcionalmente as respostas de células T regulatórias e exauridas em pacientes que evoluíram para SD durante o curso da doença. Este projeto deve fornecer informações sobre a patogênese da SD e pode revelar novos biomarcadores para prever a progressão para SD e/ou alvos para o desenvolvimento de terapia ou vacina para prevenir a progressão da SD. Através deste projeto, vou expandir minha formação em imunologia de sistemas humanos e aprender a usar abordagens multi-ômicas de célula única que espero usar no futuro para estudar coortes brasileiras longitudinais (AU)