Construção de redes de co-expressão gênica correlacionadas ao perfil de microrganismos ruminais, eficiência alimentar e deposição de gordura intramuscular em bovinos Nelore

• Processo: 21/14321-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2022
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2024
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Luiz Lehmann Coutinho
• Beneficiário: Anna Carolina Fernandes
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 19/04089-2 - O Hologenoma de Nelore: implicações na qualidade de carne e em eficiência alimentar, AP.ESCIENCE.TEM
• Assunto(s): Bos taurus indicus Eficiência alimentar Transcriptoma Genética molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bos indicus | eficiência alimentar | Marmoreio | Transcriptoma | Wgcna | Genética Molecular

Resumo

No Brasil, o rebanho bovino de corte é composto predominantemente por animais Nelore (origem Bos indicus - Zebu) ou mestiços da raça. À medida que cresce a exportação de carne brasileira, existe a necessidade da utilização eficiente dos recursos naturais visando a redução da produção de poluentes, como o gás metano (subproduto da fermentação ruminal) e outros gases do efeito estufa, diminuindo assim o impacto ambiental da pecuária. Uma maneira de atender esse objetivo é por meio da seleção de animais para melhor eficiência alimentar (EA). Ademais da necessidade de reduzir custos de produção e impactos ambientais, a conquista de novos mercados torna-se mais dependente da qualidade da carne bovina. É importante, por sua vez, além de controlar as variações ambientais, entender qual o impacto das variações genéticas sobre a regulação e variação dos fenótipos envolvidos na produção de carne. A variação da expressão gênica está associada à variação fenotípica. Os sistemas biológicos são regulados por milhares de moléculas de diferentes naturezas químicas, portanto, para compreender fenótipos complexos, uma abordagem baseada no fato de que os genes interagem uns com os outros numa rede de interações que revela uma regulação mais complexa da transcrição, pode trazer informações importantes e mais completas para a compreensão dos mecanismos que regulam tais características. Com isso, a partir de dados de sequenciamento de RNAm, estamos propondo correlacionar, respectivamente, transcriptoma do tecido ruminal, hepático e muscular, com os fenótipos de perfil de microrganismos, eficiência alimentar e deposição de gordura intramuscular. Utilizando abordagem de biologia de sistemas, por meio da construção de redes de co-expressão gênica, objetiva-se identificar conjuntos de genes co-expressos, vias metabólicas, funções e processos biológicos que regulam esses fenótipos. O estudo proposto auxiliará em uma melhor compreensão sistêmica acerca dos mecanismos moleculares que contribuem para regulação da expressão gênica de características complexas de interesse em bovinos Nelore.

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

FERNANDES, Anna Carolina. Integração de transcriptômica multi-tecidual e dados de microbioma para avaliar os efeitos de alimento alternativo na produção de metano e outros fenótipos em bovinos. 2024. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALA/BC) Piracicaba.