Perfil microbioma fecal como biomarcador de detecção precoce em Câncer Colorretal em biópsia líquida

• Processo: 21/13861-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2022
• Situação: Interrompido
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Rui Manuel Vieira Reis
• Beneficiário: Mariana Bisarro dos Reis
• Instituição Sede: Hospital do Câncer de Barretos. Fundação Pio XII (FP). Barretos , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 24/14952-8 - Assinatura de microbioma fecal para a detecção precoce do câncer colorretal em suas lesões precursoras., BE.EP.PD
• Assunto(s): Microbiota Neoplasias colorretais Diagnóstico precoce
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: câncer colorretal | Detecção precoce | lesões precursoras | Microbioma | sequenciamento MinIon | Genética

Resumo

O câncer colorretal (CCR) representa o terceiro tipo de câncer mais incidente no mundo e, no Brasil, é o segundo mais incidente e, apesar do rastreamento e novas estratégias de tratamento, continua sendo o segundo câncer mais fatal em todo o mundo. A microbiota intestinal tem sido implicada no desenvolvimento do câncer colorretal. Trabalho do nosso grupo, tem identificado o papel patogênico da fusobacterium nucleatum, no prognóstico e mais recentemente, no diagnóstico precoce destes tumores. O presente projeto pretende avaliar o perfil microbioma e seu papel como como biomarcador de detecção precoce do câncer colorretal e de suas lesões precursoras utilizando pela primeira vez a tecnologia MinION e amostras residuais de fezes preservadas em dispositivo para análise de sangue oculto nas fezes (FIT). Serão avaliadas amostras de teste de sangue oculto nas fezes imunoquímico de participantes do programa de rastreamento que apresentaram teste positivo e submetidos à colonoscopia, sendo 100 participantes sem lesão e 100 com lesão precursora ou câncer. O DNA bacteriano extraído das amostras de fezes será utilizado para amplificação das regiões variáveis do gene RNA ribossomal 16S e as bibliotecas serão sequenciadas usando o sequenciador de leitura de reads longas MinION da Nanopore. Os dados gerados serão analisados com o algoritmo baseado em nuvem EPI2ME. Esperamos identificar um perfil de microbiota associada ao diagnóstico precoce de CCR na população Brasileira. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

DATORRE, JOSE G.; DOS REIS, MARIANA B.; DE CARVALHO, ANA C.; PORTO, JUN; RODRIGUES, GABRIELA H.; LIMA, ADHARA B.; REIS, MONISE T.; HIRAI, WELINTON; HASHIMOTO, CLAUDIO L.; GUIMARAES, DENISE P.; et al. Enhancing Colorectal Cancer Screening with Droplet Digital PCR Analysis of Fusobacterium nucleatum in Fecal Immunochemical Test Samples. Cancer Prevention Research, v. 17, n. 10, p. 9-pg., 2024-10-01. (21/13861-0)