Investigando a organização nuclear do genoma de Trypanosoma cruzi, formas replicativa e não-replicativa utilizando abordagem de captura de conformação de cromatina em larga escala (Hi-C)

• Processo: 22/14056-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 13 de fevereiro de 2023
• Data de Término da vigência: 12 de abril de 2023
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Julia Pinheiro Chagas da Cunha
• Beneficiário: Natália Karla Bellini
• Supervisor: Nicolai Siegel
• Instituição Sede: Instituto Butantan. Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Ludwig Maximilian University of Munich (LMU Munich), Alemanha
• Vinculado à bolsa: 21/03219-0 - Investigação de um potencial regulador de transcrição em Trypanosoma cruzi por avaliação de transcritos nascentes do genoma global, BP.PD
• Assunto(s): Regulação transcricional Epigenômica Genomas Regulação da expressão gênica Trypanosoma cruzi
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Epigenomics | High-throughput chromosome conformation capture | Nuclear architecture | Transcription regulation | Trypanosoma cruzi | Epigenética

Resumo

Esta proposta objetiva abordar as características tridimensionais nucleares de duas formas de vida do parasita Trypanosoma cruzi e investigar seus prováveis impactos em diferentes aspectos da biologia do T. cruzi. A expressão gênica em tripanossomas é amplamente determinada por mecanismos pós-transcricionais, no entanto, uma diminuição significativa na transcrição global tem sido observada comparando suas formas de vida, sugerindo algum nível de regulação da transcrição. Além disso, o T. cruzi está sujeito a muitas mudanças epigenéticas (por exemplo, MPTs de histonas, ocupação diferencial de nucleossomos, diferentes níveis de abertura da cromatina, etc.) que mudam ao longo da vida do parasita e do ciclo celular. A organização do genoma 3D mostrou-se importante na expressão monogênica de variantes de glicoproteínas antigênicas de superfície em T. brucei. Nossa hipótese é que a organização do genoma 3D no T. cruzi também pode ser uma camada adicional de regulação da expressão gênica. Assim, propomos padronizar e obter ensaios de captura de conformação cromossômica em larga escala (Hi-C) de T. cruzi para caracterizar seu perfil 3D de cromatina em duas formas de vida. Para esta proposta, pipelines de bioinformática serão aplicados e os dados serão explorados preliminarmente para possivelmente elucidar ainda interações entre a arquitetura nuclear e o perfil epigenômico em T.cruzi. (AU)