Monitoramento do metaboloma em co-culturas microbianas utilizando hardware e software customizados

• Processo: 22/15042-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Vigência (Início): 01 de março de 2023
• Vigência (Término): 29 de fevereiro de 2024
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Farmácia
• Pesquisador responsável: Ricardo Roberto da Silva
• Beneficiário: João Vitor Guimarães Ferreira
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 17/18922-2 - Desenvolvimento de uma plataforma computacional modular extensível para análises de experimentos de metabolômica e metagenômica: inovando com a descoberta de novas atividades enzimáticas e produtos naturais de interesse farmacêutico derivados, AP.BTA.JP
• Assunto(s): Biologia computacional Evolução Microbiologia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | Evolução | Microbiologia | Bioinformática

Resumo

O presente estudo se propõe a dois objetivos: (1) desenvolver e validar um sistema de hardware e software customizado em Arduino para observar o comportamento metabólico de co-culturas microbianas ao longo de uma série temporal; e (2) avaliar as interações entre duas espécies de fungos produtoras de enzimas ligninolíticas (PhanerochaeteP. chrysosporium e TrichodermaT. reesei), numa co-cultura nesse sistema, para verificar se ocorre sinergia entre os metabólitos desses fungos. Para tal, será adaptado um sistema dispensador de líquidos, com um recipiente feito sob medida e uma placa Arduino, de modo que os meios de cultura possam ser automaticamente renovados e os metabólicos de cada geração microbiana cultivada neles, avaliados. Para a validação do sistema, usar-se-á o fungo P. chrysosporium, cujo genoma está completamente descrito na literatura. Uma vez validado o sistema, a co-cultura das espécies P. chrysosporium e T. reesei será realizada, e os metabólicos produzidos serão analisados por cromatografia e espectrometria de massa. Espera-se, ao final da pesquisa, obter tanto um sistema de monitoramento de culturas (ou co-culturas) de microrganismosbianos (e, principalmente, de seus metabólitos), quanto um panorama da evolução das enzimas ligninolíticas de P. chrysosporium e T. reesei, quando cultivadas em conjunto.