Desvendando os segredos da rizosfera: revelando o potencial dos genes funcionais microbianos para uma agricultura resistente à seca

• Processo: 23/00429-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2023
• Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2023
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Ciência do Solo
• Pesquisador responsável: Lucas William Mendes
• Beneficiário: Ana Vitória Reina da Silva
• Supervisor: Francisco Dini Andreote
• Instituição Sede: Centro de Energia Nuclear na Agricultura (CENA). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Pennsylvania State University, Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 22/00552-2 - Perfil funcional do microbioma da rizosfera de feijão tolerante à seca, BP.MS
• Assunto(s): Biologia computacional Ecologia dos micro-organismos Biologia molecular Microbiologia do solo
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformatics | microbial ecology | molecular biology | Shotgun | Microbiologia do Solo

Resumo

Aqui, apresentamos um plano de estágio de pesquisa no exterior com o objetivo de abordar de forma direta e confiável os objetivos centrais das propostas candidatas (FAPESP 2022/00552-2), que focam no processamento funcional de sequências metagenômicas de solos rizosféricos, para analisar e pesquisar para possíveis genes microbianos que ajudam a planta a suportar períodos de seca. O principal objetivo desta proposta é utilizar dados de sequenciamento do metagenoma do solo da rizosfera e aplicar ferramentas para genômica comparativa, relacionando este conjunto de dados com as propriedades químicas e físicas dos solos e outros parâmetros fisiológicos das plantas. Com base nessas análises, serão desenvolvidas as seguintes etapas: i) Análise dos dados gerados pelo sequenciamento metagenômico shotgun. Para isso, as sequências serão processadas no MG-RAST e recuperadas as tabelas taxonômicas e funcionais, e a estrutura das comunidades será avaliada por análise de diversidade alfa e beta, correlação e análise de redes; e ii) Interpretação ecológica do conjunto de dados. Para isso, todos os conjuntos de dados serão interpretados em um contexto ecológico, considerando suas implicações. Os resultados esperados deste estágio de pesquisa no exterior permitirão uma melhor compreensão das relações planta-microorganismo e suas aplicações em projetos de agricultura sustentável. (AU)