| Processo: | 22/16208-9 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado Direto |
| Data de Início da vigência: | 01 de maio de 2023 |
| Data de Término da vigência: | 31 de outubro de 2023 |
| Área de conhecimento: | Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal |
| Pesquisador responsável: | Marie-Anne Van Sluys |
| Beneficiário: | Henrique Moura Dias |
| Supervisor: | James Carey Schnable |
| Instituição Sede: | Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil |
| Instituição Anfitriã: | University of Nebraska-Lincoln (UNL), Estados Unidos |
| Vinculado à bolsa: | 19/08239-9 - Investigando os aspectos biológicos de THI1 em plantas, BP.DD |
| Assunto(s): | Poaceae Cana-de-açúcar Genômica comparativa Mapeamento genético Genes sintéticos Tiamina |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | Mapping syntenic genes | Plant Comparative Genomics | Poaceae | sugarcane | Thiamine pathway genes | Genômica comparativa |
Resumo O desenvolvimento de um conjunto de genes sintéticos pan-gramínea pode produzir uma visão de alta resolução dos padrões e processos de evolução molecular. No entanto, alavancar informações em vários genomas continua sendo um desafio significativo em quase todos os sistemas eucarióticos, especialmente a cana-de-açúcar, uma gramínea altamente poliploide. Esses desafios vão desde estudar a evolução da estrutura cromossômica posicionando genes candidatos para loci de características quantitativas, até testar hipóteses sobre especiação, domesticação e adaptação. Aqui, apresentamos uma proposta de estágio de pesquisa no exterior BEPE, que aborda esses desafios integrando a ortologia de genes da via de tiamina (altamente conservados) para definir a posição física esperada de todos os genes em vários genomas de gramíneas englobando a inclusão da cana-de-açúcar R570 no Pan Grass Syntenic Gene Set desenvolvido pelo grupo de pesquisa do professor James Schnable. Propõe-se inicialmente o desenvolvimento de tal abordagem com o uso da referência monoploide da cana-de-açúcar (R570), onde buscaremos dissecar a presença-ausência, número de cópias e variação estrutural que abrange o conjunto sintênico desenvolvido pelo grupo no exterior. Métodos para construir e visualizar a ortologia sintênica, bem como a inclusão da cana-de-açúcar, podem oferecer um acréscimo significativo à comunidade de estudos genômicos da cana-de-açúcar. (AU) | |
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