Estudo dos impactos conformacionais em produtos de genes com variantes não-sinônimas com configurações cis

• Processo: 22/15941-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2023
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Michel Satya Naslavsky
• Beneficiário: Camila Hosoe Takase
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Genes Variantes genéticas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: cis | Dobramento de Proteinas | genes | variantes não-sinônimas | Variantes genéticas

Resumo

Variantes em regiões gênicas podem ter efeitos funcionais sobre seus produtos com potenciais consequências em fenótipos clínicos. Variantes codificantes não-sinônimas, cujo aminoácido é substituído, podem ter impactos na estrutura da proteína e, portanto, em sua função. A análise e avaliação dos efeitos da presença simultânea de duas ou mais variantes codificantes não-sinônimas em cis (no mesmo cromossomo homólogo) quanto à estrutura da proteína formada e consequências fenotípicas para o indivíduo portador são comumente relegadas em comparação à investigação de implicações decorrentes de variantes não sinônimas analisadas de maneira isolada. O projeto tem por objetivo investigar a ocorrência de variantes codificantes não-sinônimas em cis em uma amostra populacional de brasileiros e seu impacto na estrutura proteica. Será utilizada uma amostra populacional de brasileiros a partir dos dados de sequenciamento de genomas completos obtidos das coortes SABE (Saúde, Bem-estar e Envelhecimento) como base para a filtragem de variantes não-sinônimas. A partir disso, sabendo da existência de uma abundância de genes com configurações em cis de variantes codificantes em genomas humanos, serão realizadas filtragens para identificação de potenciais variantes em cis. Com base nos genes obtidos pela fase anterior serão buscados aqueles para os quais a estrutura tridimensional da proteína codificada se encontra resolvida e disponível, de forma a ser possível avaliar e comparar os impactos decorrentes da co-ocorrência de variantes em cis com a ocorrência de uma única variante isolada, buscando elucidar seus efeitos e promover um maior foco para esse âmbito. Espera-se contribuir com o entendimento sobre o efeito combinado de mais de uma variante em um mesmo produto gênico em relação aos efeitos das variantes isoladamente.