Prospecção de módulos de genes co-expressos relacionados ao metabolismo energético do músculo esquelético estriado de bezerros Nelore submetidos a desmama precoce.

• Processo: 23/02660-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2023
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2024
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Guilherme Luis Pereira
• Beneficiário: Rebeca Soares Nogueira
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia (FMVZ). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Assunto(s): Bos taurus indicus Nutrigenômica Qualidade da carne Transcriptoma
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bos indicus | Nutrigenômica | qualidade de carne | Transcriptoma | Co-expressão de genes de bezerros Nelore

Resumo

Dentro da bovinocultura de corte, diferentes estratégias têm sido utilizadas nas últimas décadas para melhorar a eficiência da produção e qualidade de cortes na raça Nelore (Bos indicus). Inexistem pesquisas que avaliaram o efeito da desmama precoce suplementada sobre a co-expressão gênica no músculo estriado de bezerros zebuínos. Desta forma, este estudo terá como objetivo analisar a co-expressão gênica do músculo esquelético estriado de bezerros nelore submetidos a desmama precoce. Para isso, foram utilizados 8 bezerros machos nelore, não castrados, nascidos em um intervalo de 20 dias, filhos de mães contemporâneas e de mesma ordem de parto. Estes, foram desmamados aos 120 dias de idade, realocados em piquete com pastagem Tifton 85 e suplementados com ração concentrada até os 205 dias, momento em que foram realizadas as coletas do tecido muscular por meio de biópsia. A partir, então, de alíquotas do músculo Longissimus thoracis foram gerados transcriptomas com cobertura média de 18 milhões de "reads" por amostra, por meio de RNA-Seq, dos 8 indivíduos. A análise de co-expressão gênica será conduzida considerando a contagem dos transcritos das 8 amostras por meio por meio do pacote WGCNA no ambiente do software R. O seu uso permitirá, por meio de cálculos de conectividade, matriz de adjacência, correlação de Pearson e medidas de sobreposição topológica, a identificação de redes e módulos, os quais serão anotados quanto aos processos biológicos e vias metabólicas de que participam, utilizando análises de enriquecimento funcional de seus genes. Além de trazer informações de módulos gênicos, também será possível identificar hub-genes e genes regulatórios nas redes e nos módulos. Desse modo, será possível entender como a modificação da ingestão de nutrientes na fase pós-parto influência o metabolismo energético muscular de bovinos zebuínos de corte.