Análise integrativa sistêmica de tumores associados às infecções por oncovírus humanos

• Processo: 23/06086-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2023
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Imunologia - Imunologia Celular
• Pesquisador responsável: Otávio Cabral Marques
• Beneficiário: Pedro Marçal Barcelos
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas (FCF). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 18/18886-9 - Análise sistêmica e integrativa da resposta imune às infecções virais por Zika e Dengue, AP.JP
• Assunto(s): Neoplasias
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: câncer | Imunologia | Oncovírus | Imunologia Integrativa Sistêmica

Resumo

Vírus associados a tumores foram descritos ainda na primeira metade do século XX e hoje em dia a estimativa é de que de 15 a 20% dos tumores malignos tenham uma etiologia viral1-2. Sete vírus, até o momento, são considerados oncovírus humanos; Vírus Epstein-Barr (EBV), vírus da Hepatite B, papilomavírus humano (HPV), vírus linfotrópico humano de células T (HTLV), vírus da hepatite C, HerpesvUus humano 8 (KSHV) e o poliomavírus das células de Merkel (MCV). Apesar da diversidade presente entre os vírus, sendo eles pertencentes a diferentes famílias com genomas de RNA e DNA e diferentes mecanismos que levam a transformação tumoral, eles carregam algumas similaridades. Na maior parte dos casos, as infecções por esses vírus são comuns na população, porém a maioria não desenvolve câncer. A infecção não costuma lisar células hospedeiras, contudo é persistente, desenvolvendo mecanismos de evasão à resposta imune. Por fim, apenas a infecção não é suficiente para desencadear o processo de tumorigênese, ela precisa de outros fatores de risco como supressão da resposta imune, inflamação crônica, entre outros 3. O objetivo desse projeto é caracterizar as vias biológicas alteradas em cada uma das infecções virais para avaliar possíveis alvos comuns a esses vírus. Iremos realizar uma análise integrativa dos dados de sangue periférico disponíveis em bancos de dados públicos, como GEO 4, ArrayExpress 5, Proteome X Change, ou dados publicados em artigos científicos para obter uma visão global das infecções e o processo de transformação do tumor. Cada infecção será analisada individualmente e uma meta-análise visando averiguar possíveis similaridades será conduzida. Utilizando a técnica de aprendizagem de máquinas (Random Forest), um ranqueamento dos genes nos permitirá classificar os genes diferencialmente expressos (GDE) maior relevância para predição da carcinogênese. Dessa forma, através das análises computacionais integrativas e sistêmicas, o estudo poderá caracterizar e identificar novos alvos para possíveis intervenções terapêuticas ou diagnósticas a fim de mitigar o impacto dessas infecções nos eventuais processos oncogênicos.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

FONSECA, DENNYSON LEANDRO M.; JAEPEL, MAJ; GYAMFI, MICHAEL ADU; FILGUEIRAS, IGOR SALERNO; BAIOCHI, GABRIELA CRISPIM; OSTRINSKI, YURI; HALPERT, GILAD; LAVI, YAEL BUBLIL; VOJDANI, ELROY; SILVA-SOUSA, THAYNA; et al. Dysregulated autoantibodies targeting AGTR1 are associated with the accumulation of COVID-19 symptoms. NPJ SYSTEMS BIOLOGY AND APPLICATIONS, v. 11, n. 1, p. 13-pg., 2025-01-13. (20/16246-2, 19/27139-5, 18/18886-9, 20/01688-0, 23/13356-0, 20/07972-1, 23/12268-0, 23/07806-2, 23/06086-6, 20/09146-1, 20/07069-0)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

BARCELOS, Pedro Marçal. Caracterização da rede regulatória e descoberta de genes prognósticos em gliomas. 2025. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Conjunto das Químicas (IQ e FCF) (CQ/DBDCQ) São Paulo.