Estudo de RNAs não codificantes transcritos a partir de regiões de início ou término de transcrição no genoma de Leishmania (Viannia) braziliensis

• Processo: 23/04973-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2023
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2024
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Parasitologia - Protozoologia de Parasitos
• Pesquisador responsável: Angela Kaysel Cruz
• Beneficiário: Brenda Nobile de Freitas
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Expressão gênica Leishmania RNAs não codificadores Parasitologia molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: expressão gênica | leishmania | RNAs não codificantes | Transcrição Policistrônica | Parasitologia Molecular

Resumo

Parasitos do gênero Leishmania spp. são os causadores do complexo de doenças tropicais e subtropicais negligenciadas chamadas leishmanioses. No Brasil, Leishmania (Viannia) braziliensis é o principal agente etiológico da forma tegumentar da doença. Durante o seu ciclo de vida, o protozoário alterna entre ambientes hostis com características bastante distintas: o sistema digestivo do inseto vetor e as células fagocíticas do hospedeiro mamífero. Para sobreviver a tal diversidade o parasito conta com uma maquinaria genética peculiar aos tripanossomatídeos, que confere agilidade na modulação da expressão gênica pois baseia-se principalmente em mecanismos de controle pós-transcricionais. Este estudo tem como finalidade verificar o papel regulatório de RNAs não codificantes longos (lncRNAs), diferencialmente expressos durante o ciclo de vida de L. braziliensis, presentes em sítios de troca de fita (SSRs), de onde convergem (cSSRs) ou divergem (dSSR) duas unidades policistrônicas contíguas. Inicialmente, será feita a comprovação da expressão diferencial estimada por RNAseq para 4 lncRNAs, por RT-qPCR. A seguir, será investigado o efeito da superexpressão destes transcritos. As linhagens parentais e superexpressoras para os DE lncRNA serão avaliadas comparativamente quanto à expressão de genes posicionados à montante e à jusante das respectivas SSRs em que esses elementos estão localizados. Além disso, as proteínas ligantes destes DE lncRNAs serão identificadas, por ensaios de pull-down seguidos de Espectometria de Massas e análise computacional correspondente. Desta maneira, testaremos a hipótese de que esses DE lncRNAs possam ser elementos cis-regulatórios envolvidos na regulação da transcrição das PTUs à montante e à jusante das SSRs em que sua sequência está presente.