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Fundamentação bioinformática das análises sistêmicas e integrativas de infecções virais.

Processo: 23/07806-2
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
Vigência (Início): 01 de agosto de 2023
Vigência (Término): 31 de janeiro de 2025
Área do conhecimento:Interdisciplinar
Pesquisador responsável:Otávio Cabral Marques
Beneficiário:Igor Salerno Filgueiras
Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:18/18886-9 - Análise sistêmica e integrativa da resposta imune às infecções virais por Zika e Dengue, AP.JP
Assunto(s):Biologia computacional   Capacitação   Viroses
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:bioinformática | capacitação | Infecções Virais | Bioinformática

Resumo

Auxiliar na estruturação do grupo de pesquisa e facilitar a integração dos novos membros. Para isso, padronizar os códigos desenvolvidos e em desenvolvimento por membros antigos e atuais da equipe. Preparar um repositório com dados de entrada, script e saída para cada tipo de análise. Estabelecer um banco de dados relacional contendo informações chave para nossos projetos. Dar suporte às diversas análises estatísticas e de aprendizagem de máquina empregadas em cada projeto. Iniciar os novos membros na utilização e escolha de parâmetros dos softwares comumente usados pelo grupo, como Rstudio, Jupyter, Linux (Bash), Sophia, PathDIP, NAViGATor, Network Analyst, EnrichR, Interferome, entre outros. Instruir a equipe na utilização de Bash voltado às análises ômicas, bem como scripts de Python e R para as análises já mencionadas.

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
BARRETO, MARINA DOS SANTOS; DA SILVA, BEATRIZ SOARES; SANTOS, RONALDY SANTANA; SILVA, DEISE MARIA REGO RODRIGUES; SILVA, ELOIA EMANUELLY DIAS; MOURA, PEDRO HENRIQUE MACEDO; DE SOUZA, JESSIANE BISPO; SANTANA, LUCAS ALVES DA MOTA; FONSECA, DENNYSON LEANDRO M.; FILGUEIRAS, IGOR SALERNO; et al. COVID-19 Vaccination and Serological Profile of a Brazilian University Population. LIFE-BASEL, v. 13, n. 9, p. 14-pg., . (18/18886-9, 20/16246-2, 23/07806-2)

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