Co-expressão de lncRNA correlacionados com características de interesse em modelo animal para doenças metabólicas em humanos

• Processo: 23/06442-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Vigência (Início): 01 de setembro de 2023
• Vigência (Término): 31 de janeiro de 2025
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Aline Silva Mello Cesar
• Beneficiário: Lucas Echevarria Nascimento
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 17/25180-2 - Efeito da adição de ácido oléico na dieta de suínos sobre o perfil da resposta imunológica e de ácidos graxos de diferentes tecidos, AP.JP
• Bolsa(s) vinculada(s): 23/14662-7 - Co-expressão de lncRNA correlacionados com características de interesse em modelo animal para doenças metabólicas em humanos, BE.EP.MS
• Assunto(s): Fígado Lipídeos RNA longo não codificante Nutrigenômica Suínos Genômica funcional
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: fígado | lipídios | LncRNA | Nutrigenômica | suíno | genômica funcional

Resumo

A nutrição desempenha um papel importante na saúde do indivíduo, pois influencia diretamente na expressão de genes específicos responsáveis por importantes vias metabólicas (RAMOS-LOPEZ et al., 2017). De acordo com Bouchard e Ordovas (2012), a nutrigenômica evoluiu para incluir o estudo dos efeitos dos nutrientes na expressão gênica e eventos moleculares e biológicos relacionados, incorporando importantes resultados da transcriptômica, proteômica e metabolômica. A importância do uso dos suínos em estudos de nutrigenômica é a sua relevância na oferta de proteína de alto valor nutricional e na economia mundial por meio da produção e consumo da sua carne. A carne suína apresenta importante papel na dieta humana, composta por fontes de proteína com alto valor biológico e ácidos graxos essenciais como ácido linoléico e linolênico (AG), fornecendo nutrientes que podem proporcionar às pessoas dietas seguras, saudáveis e equilibradas (PARK et al., 2012; DUGAN et al., 2015; MOGHADASIAN e SHAHIDI, 2017). Estudos anteriores do nosso grupo de estudo mostraram que a adição de diferentes níveis de óleo de soja à dieta de suínos em crescimento e terminação está relacionada tanto à modificação dos perfis de expressão gênica do fígado quanto ao envolvimento na modulação de fatores de transcrição (FANALLI et al., 2022; FANALLI et al., 2023). No fígado, em um estudo anterior realizado por pelos integrantes do grupo, foi identificada a maior quantidade de genes diferencialmente expressos (GDE), 281 e vias de sinalização relacionada a doenças neurodegenerativas (FANALLI et al., 2022b). Dentre os RNAs reguladores recentemente identificados estão os lncRNA (do inglês, long noncoding RNA) que são uma classe heterogênea de ncRNA (do inglês, noncoding RNA) que possuem mais de 200 nucleotídeos, os quais estão envolvidos em diversos processos biológicos, incluindo o desenvolvimento, diferenciação celular, respostas imunes, ciclo celular e deposição de gordura subcutânea, regulando a expressão gênica. (HARROW et al., 2012; FATICA e BOZZONI, 2014; LIU et al., 2018). Segundo Zeng et al., 2018, os lncRNA agem no metabolismo lipídico controlando a adipogênese, o metabolismo, transporte de ácidos graxos (AG), colesterol e fosfolipídios, e têm a capacidade de atuar na formação de lipoproteínas de alta densidade (HDL) e de baixa densidade (LDL). Dessa forma, o objetivo deste projeto é realizar uma análise de co-expressão gênica de lncRNA e correlacionar os grupos de lncRNA co-expressos com características de interesse econômico e de saúde seguindo a metodologia proposta por Zhang e Horvath (2005) e Langfelder e Horvath (2008), WGCNA (Weighted Correlation Network Analysis). Esta é uma abordagem de biologia de sistemas que permite identificar os padrões de correlação ou co-expressão entre os milhares de genes expressos em um tecido em um determinado momento com base nos dados de expressão gênica em larga escala.