Relações filogenéticas intraespecíficas de Cereus calcirupicola: uma espécie politípica e associada a afloramentos calcários no leste do Brasil

• Processo: 23/07832-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Vigência (Início): 01 de setembro de 2023
• Vigência (Término): 31 de dezembro de 2024
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
• Pesquisador responsável: Fernando de Faria Franco
• Beneficiário: Juliana Palmeira Garcia
• Instituição Sede: Centro de Ciências Humanas e Biológicas (CCHB). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). Sorocaba , SP, Brasil
• Assunto(s): Marcador molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Afloramento de calcário | Cactaceae591 | Captura de sequência | Cereus calcirupicola | Filogenia do Gênero Cereus | marcador molecular | Filogenia de Cereus

Resumo

A região Neotropical apresenta uma vasta diversidade cuja explicação geralmente está associada a eventos geomorfológicos no Mioceno e Plioceno e/ou oscilações climáticas do Quaternário. Dentre as áreas de vegetação aberta da "diagonal de formações abertas" da América do Sul, destacam-se a Caatinga, uma floresta tropical sazonalmente seca, e o Cerrado, um domínio heterogêneo composto por vegetações savânicas. O ecótono entre esses biomas apresenta cadeias de afloramentos de calcário, que abrigam muitas espécies endêmicas. Por ser um modelo de ilhas continentais é possível que a diversificação nesse ambiente seja favorecida pela fragmentação. A espécie politípica Cereus calcirupicola Ritter (Cactacae; Cereeae) apresenta variedades ao longo de sua distribuição, as quais já foram descritas como nomes obsoletos no passado. Estudos filogenéticos com ampla amostragem dessa espécie ainda não foram realizados. O objetivo deste projeto é obter dados genéticos para diversas populações de C. calcirupicola utilizando captura de sequências com o painel de ortólogos Cactaceae591. A partir dos dados coletados serão realizadas reconstruções filogenéticas para avaliar a presença de linhagens intraespecíficas em C. calcirupicola e investigar a monofilia recíproca de linhagens relacionadas à sinônimos obsoletos. A preparação da biblioteca genômica e sequenciamento serão terceirizados. Após o processamento dos dados brutos, filtragens por qualidade, montagem das regiões alvo, investigação de paralogia serão realizadas em reconstrução filogenéticas tradicionais (máxima verossimilhança) e coalescentes (quartetos). O projeto deve contribuir para a compreensão da diversidade de espécies de cactáceas, especificamente dentro do subgênero Cereus. Além de testar a utilização do painel Cactaceae591 no nível intraespecífico.