EVOLUÇÃO MOLECULAR NO GÊNERO Cereus (CACTACEAE; CEREAE): SELEÇÃO POSITIVA EM REGIÕES EXÔNICAS DO PAINEL CACTACEAE591

• Processo: 23/03411-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2023
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2024
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
• Pesquisador responsável: Fernando de Faria Franco
• Beneficiário: Matheus Vieira da Silva
• Instituição Sede: Centro de Ciências Humanas e Biológicas (CCHB). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). Sorocaba , SP, Brasil
• Assunto(s): Marcador molecular Seleção natural Fitogeografia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: dS | marcadores moleculares | Seleção Natural | Sequenciamento de captura | Taxa de dN | Fitogeografia

Resumo

O gênero Cereus Mill. (Cactaceae) é composto por cerca de 31 espécies, sendo a sua maioria encontradas na América do Sul. Reconstruções biogeográficas para esse gênero sugerem que algumas transições geográficas entre biomas estão associadas à evolução de nicho. Dessa forma, é possível que a seleção natural tenha desempenhado um papel importante na evolução do grupo. Recentemente, foi gerada uma base de dados moleculares de 292 regiões exónicas utilizando o painel para genes ortólogos Cactaceae591 para diversas espécies de Cereus, com representantes das principais linhagens evolutivas do gênero. No presente projeto, essa base de dados será utilizada com o objetivo de investigar assinatura de seleção positiva nessas regiões através de análises baseadas em taxas de substituições sinônimas e não sinônimas. Brevemente, as análises serão conduzidas nos softwares MEME Suite, FUBAR, PAML e Selecton, utilizando os modelos de "Branch Model", "Site Model" e "Branch-site Model". A hipótese de trabalho é que ao menos parte dos exons analisados apresentem sinais de seleção positiva, sobretudo em linhagens que possuem indicativos de evolução de nicho, conforme estudos prévios do grupo. Considerando o potencial uso do painel Cactaceae591 para estudos filogenéticos em cactos, o presente estudo deve adicionar relevante informação empírica sobre o nível de seleção encontrado em regiões sequenciadas com o uso deste painel.