Análise de sequências repetitivas no genoma de Proceratophrys laticeps, espécie de sapo endêmica da Mata Atlântica brasileira

• Processo: 23/13746-2
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2023
• Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2024
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: Patricia Pasquali Parise Maltempi
• Beneficiário: Natália Ayres Leite
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Rio Claro. Rio Claro , SP, Brasil
• Assunto(s): Sequências repetitivas de ácido nucleico
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: DNA repetitivo | Citogenética animal

Resumo

DNAs satélites são caracterizados como sequências de DNA repetitivo organizados em tandem, frequentemente presentes em grande quantidade na heterocromatina de diversos organismos. Neste trabalho, serão analisadas sequências repetitivas no genoma do sapo Proceratophrys laticeps, que ocorre nas regioes sudeste dos estados da Bahia e Espírito Santo, e nordeste dos estados de Minas Gerais e Rio de Janeiro, Brasil. Com relação à dados citogenéticos, a espécie P. laticeps possui um número diploide de 2n = 22 cromossomos, bandas C-positivas predominantemente localizadas como blocos discretos na região do centrômero dos cromossomos, além de ausência de cromossomos sexuais heteromórficos diferenciados. Por meio da análise de dados genômicos de P. laticeps, utilizando ferramentas de bioinformática como RepeatExplorer2, TAREAN e RepeatMasker, será feita uma caracterização completa de DNA satélites desta espécie de sapo, realizando uma análise comparativa da abundância e divergência dessas sequências no genoma. A caracterização e análises de abundância e divergência genômica comparativa são preponderantes para o estudo de sequências repetitivas, sobretudo do ponto de vista evolutivo de sequências de DNAs satélites. Desta forma, estudos sobre o conteúdo genômico em P. laticeps são de extrema importância, devido a escassez de trabalhos utilizando genomas sequenciados de anfíbios anuros. Alguns trabalhos têm reforçado que anfíbios anuros são excelentes organismos para estudos citogenômicos, e este trabalho se torna interessante pela possibilidade de acrescentar dados genômicos e associações evolutivas de sequências repetitivas para um grupo de anfíbios anuros endêmicos da Mata Atlântica brasileira.