Mapeamento de candidatos a haplótipos letais e regiões genômicas associadas a ocorrência de aborto e mortalidade pré-desmame em bovinos da raça Nelore

• Processo: 23/11176-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Vigência (Início): 01 de dezembro de 2023
• Situação: Interrompido
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Maria Eugênia Zerlotti Mercadante
• Beneficiário: Gustavo Roberto Dias Rodrigues
• Instituição Sede: Instituto de Zootecnia. Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). Secretaria de Agricultura e Abastecimento (São Paulo - Estado). Nova Odessa , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 17/10630-2 - Aspectos genéticos da qualidade, eficiência e sustentabilidade da produção de carne em animais da raça Nelore, AP.TEM
• Auxílio(s) vinculado(s): 24/04755-0 - 75ª reunião anual da Associação Europeia de Produção Animal, AR.EXT
• Bolsa(s) vinculada(s): 24/01909-7 - Varredura do genoma para regiões de distorção da taxa de transmissão e suas associações com aborto, natimorto e mortalidade pré-desmame em bovinos Nelore, BE.EP.MS
• Assunto(s): Polimorfismo de um único nucleotídeo Variantes genéticas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: associação genômica ampla | Homozigose recessiva | SNPs | Variantes Genéticas | Haplótipos letais

Resumo

Este projeto de pesquisa tem como objetivo realizar o mapeamento de haplótipos letais e a identificação de regiões genômicas associadas à ocorrência de aborto, mortalidade pré-desmame em bovinos da raça Nelore. Os dados que serão utilizados neste estudo foram coletados ao longo de mais de quatro décadas pelo Centro Avançado de Pesquisa e Desenvolvimento em Bovinos de Corte, situado em Sertãozinho, São Paulo, Brasil. A amostragem contempla 2.723 animais genotipados e aproximadamente 13.600 nascimentos, incluindo registros de aborto, natimorto, e mortalidade pré-desmame. A identificação dos candidatos a haplótipos letais será feita por meio do método de janelas deslizantes, sendo observados os haplótipos com prevalência superior a 2% na população e com frequências abaixo do esperado em estado homozigoto recessivo. Análises de associação ampla do genoma (GWAS) serão realizadas para identificar SNPs (Polimorfismos de Nucleotídeo Único) localizados em regiões próximas (100 kb ao redor) ou dentro dos haplótipos letais, e que estão relacionados com a ocorrência de aborto, natimorto ou mortalidade pré-desmame. Os resultados obtidos por meio deste estudo contribuirão significativamente para a compreensão da estrutura genética de variantes deletérias associadas ao aborto e a mortalidade pré-desmame em bovinos da raça Nelore. Assim, estratégias de seleção e acasalamento poderão ser aplicadas de forma mais eficiente e, em perspectiva futura, técnicas de edição genética poderão ser utilizadas para mitigar problemas que influenciam a eficiência reprodutiva e a sobrevivência de bezerros até o desmame em rebanhos comerciais.