Uso do 18s rRNA para a caracterização da biodiversidade eucariótica da Laje de Santos

• Processo: 23/12613-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de janeiro de 2024
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Oceanografia - Oceanografia Biológica
• Pesquisador responsável: Rodrigo Rodrigues Domingues
• Beneficiário: Julia Silva Antonio
• Instituição Sede: Instituto Oceanográfico (IO). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 19/10201-0 - Biodiversidade marinha: uma exploração das ilhas costeiras de São Paulo usando DNA ambiental metabarcoding, AP.BTA.JP
• Assunto(s): DNA ambiental Ecologia marinha Áreas de conservação
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Conservação marinha | DNA ambiental | DNA metabarcode | Ecologia Marinha | unidade de conservação | Oceanografia, Genética da conservação, Ecologia molecular

Resumo

A compreensão da biodiversidade associada a ecossistemas específicos é fundamental para entender padrões biogeográficos e, sobretudo, para desenvolver estratégias de análise, prevenção e mitigação de possíveis desequilíbrios ecológicos. Esse aspecto tem ganhado importância crescente no ambiente marinho nos últimos anos devido ao aumento das atividades humanas e influências neste meio, que resultaram em mudanças significativas no número de espécies eindivíduos que habitam determinadas regiões. Isso ocorre devido, por exemplo, à pesca, à descarga irregular de resíduos industriais e à introdução de espécies invasoras, que por sua vez, desestabilizam as relações ecológicas harmoniosas entre os diferentes níveis tróficos presentes no ecossistema. Nesse contexto, os métodos moleculares de análise da biota se destacam como alternativas viáveis e eficazes para estudar a biodiversidade dos mais diversos ecossistemas marinhos. A técnica de metabarcode permite a identificação de diferentes espécies de organismos presentes em um determinado local a partir da análise de diferentes regiões genômicas (e.g., 18S, 12S, COI) do material genético extraído de uma amostra ambiental. No entanto, um dos aspectos cruciais na eficiência do metabarcode é o uso de regiões genômicas capazes de distinguir uma série de espécies e o uso de primers específico para um determinado grupo, capazes de detectar o maior número possível de espécies, minimizando a ocorrência de falsos positivos e/ou negativos, que podem afetar diretamente o resultado da análise. O uso combinado dos marcadores moleculares COI e 18s, estão entre os mais utilizados em estudos de levantamento faunísticos em ambientes marinhos, pois fornecem uma compreensão mais abrangente e precisa da biodiversidade. O COI é frequentemente usado para a identificação em nível de espécie sendo particularmente útil para distinguir espécies intimamente relacionadas. Por outro lado, o 18S rRNA é mais conservado, sendo, portanto, mais adequado para estudar as relações entre níveis taxonômicos mais elevados. Portanto, combinar ambos os marcadores permitem a captura de uma gama mais ampla de informações taxonômicas. Deste modo, o presente projeto objetiva a padronização do uso do marcador 18s para o levantamento da biodiversidade marinha em uma das áreas com maior diversidade de espécies da costa brasileira.