Investigação genômica de probióticos/bacteriocinas para o tratamento de patógenos resistentes a antimicrobianos

• Processo: 23/16216-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2024
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
• Pesquisador responsável: Sergio Schenkman
• Beneficiário: João Pedro Rueda Furlan
• Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 21/10599-3 - Instituto Paulista de Resistência aos Antimicrobianos (Projeto ARIES), AP.CEPID
• Assunto(s): Biologia celular e molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: AMR evolution | genomic analysis | WHO critical priority pathogens | Biologia molecular e celular

Resumo

Análise genômica para identificação de probióticos/bacteriocinas. Análise de resistomas, virulomas e filogenômica de patógenos resistentes a antimicrobianos de prioridade crítica circulantes na cadeia alimentar (pecuária, gado leiteiro, carne), no Brasil. Conceituação, metodologia, investigação e estratégias para desenvolvimento de projetos. Obtenção de big data e incorporação/atualização de dados genômicos e microbiológicos na plataforma OneBR (http://www.onehealthbr.com/). Aplicação da pesquisa de probióticos/bacteriocinas para descolonização de hospedeiros colonizados por patógenos virulentos e/ou resistentes a antimicrobianos. Modelos in vivo para teste de probióticos/bacteriocinas. Extrações de DNA, sequenciamento e preparação de bibliotecas. Análise dos dados. Redação, revisão e edição de manuscritos, relatórios e patentes.

Publicações científicas

(7)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

SELLERA, FABIO PARRA; ZHUANG, YILU; LINCOPAN, NILTON; STEHLING, ELIANA GUEDES; SCHENKMAN, SERGIO; RUAN, ZHI; FURLAN, JOAO PEDRO RUEDA. Genomic tracking the coexistence of mcr and carbapenemase genes in Gramnegative bacteria: a global perspective. INTERNATIONAL JOURNAL OF ANTIMICROBIAL AGENTS, v. 64, n. 5, p. 3-pg., 2024-10-16. (23/16216-4)

DA SILVA, MEIRE MARIA; SELLERA, FABIO PARRA; FURLANE, JOAO PEDRO RUEDA; ARAVENA-RAMIREZ, VALENTINA; FUENTES-CASTILLO, DANNY; FUGA, BRUNA; FROESI, ALEXANDRE JOSE DOS SANTOS; DE SOUSAI, ALANA LISLEA; GARINO JUNIOR, FELICIO; LINCOPAN, NILTON. Gut colonization of semi-aquatic turtles inhabiting the Brazilian Amazon by international clones of CTX-M-8-producing Escherichia coli. Veterinary Microbiology, v. 301, p. 8-pg., 2024-12-23. (20/08224-9, 23/16216-4)

FURLAN, JOAO PEDRO RUEDA; ZARRILLI, RAFFAELE; DAOUD, ZIAD; HE, FANG; RUAN, ZHI. Editorial: Global dissemination and evolution of epidemic multidrug-resistant Gram-negative bacterial pathogens: surveillance, diagnosis and treatment, volume III. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 16, p. 4-pg., 2025-03-12. (23/16216-4)

ZHUANG, YILU; LI, SHUANGSHUANG; BAO, DANNI; FURLAN, JOAO PEDRO RUEDA; RUAN, ZHI. Genomic integrity in Bordetella pertussis: avoiding contaminant-derived misinterpretations of acquired antimicrobial resistance. Journal of Infection, v. 89, n. 6, p. 2-pg., 2024-12-01. (23/16216-4)

LI, XINYANG; ZHUANG, YILU; YU, YAWEN; JIA, HUIQIONG; KONG, YINGYING; ZHANG, JUN; XIE, XINYOU; STEHLING, ELIANA GUEDES; FURLAN, JOAO PEDRO RUEDA; ZHOU, ZHEMIN; et al. Interplay of multiple carbapenemases and tigecycline resistance in Acinetobacter species: a serious combined threat. Clinical Microbiology and Infection, v. 31, n. 1, p. 6-pg., 2024-12-16. (23/16216-4)

JIA, HUIQIONG; TONG, QINGCHAO; WANG, LE; WU, YUYE; LI, XINYANG; LI, SHUANGSHUANG; KONG, YINGYING; ZHANG, YINGYING; FURLAN, PEDRO RUEDA; KHINE, NWAI OO; et al. Silent circulation of plasmid-borne tet(X6) and blaOXA-58 genes in a community-acquired Acinetobacter baumannii strain. DRUG RESISTANCE UPDATES, v. 79, p. 4-pg., 2024-12-27. (23/16216-4)

FURLAN, JOAO PEDRO RUEDA; SELLERA, FABIO PARRA; LINCOPAN, NILTON; DEBONE, DANIELA; MIRAGLIA, SIMONE GEORGES EL KHOURI; TAVELLA, RONAN ADLER. Catastrophic floods and antimicrobial resistance: Interconnected threats with wide-ranging impacts. ONE HEALTH, v. 19, p. 3-pg., 2024-12-01. (23/16216-4, 24/02579-0, 23/04466-6, 24/02476-7)