Desvendando a interação entre bactérias e fagos por meio do monitoramento das alterações transcritômicas durante a infecção por fagos.

• Processo: 24/01159-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2024
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Biologia e Fisiologia dos Microorganismos
• Pesquisador responsável: João Carlos Setubal
• Beneficiário: Guilherme Wenceslau de Lima Cardoso
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 21/10577-0 - Centro de Pesquisa em Biologia de Bactérias e Bacteriófagos (CEPID B3), AP.CEPID
• Assunto(s): Bacteriófagos Pseudomonas aeruginosa Análise de sequência de RNA
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bacteriófagos | fago lítico | Fagoterapia | Pseudomonas aeruginosa | RNA-seq | Transcritômica | Biologia de Bacteriófagos

Resumo

A predação bacteriana por fagos impulsiona uma corrida armamentista contínua entre fago e sua hospedeira. Enquanto as bactérias se defendem da predação por fagos com um grande repertório de sistemas de defesa, os fagos desenvolvem estratégias cruciais para o sucesso de sua infecção e propagação. A compreensão dessas interações pode revelar como o fago modula o metabolismo bacteriano e inibe os mecanismos de defesa bacteriana para estabelecer uma infecção eficaz, além de ser importante para o desenvolvimento bem-sucedido de aplicativos baseados em fagos. Entre as abordagens empregadas para descobrir os mecanismos de interação entre fago e hospedeiro, a análise transcritômica usando sequenciamento de RNA (RNA-seq) provou ser uma ferramenta valiosa para estudar o perfil de expressão de genes de fagos e bactérias durante a infecção. Este projeto tem como objetivo investigar as interações entre fago e a hospedeira ao longo do ciclo de infecção de Pseudomonas aeruginosa PA14 com os fagos ZC01 (Siphoviridae; Abidjanvirus; Abidjanvirus não classificado) e ZC03 (Schitoviridae; Zicotriavirus; Pseudomonas virus ZC03) que isolamos e caracterizamos anteriormente. Esses são fagos não relacionados genômica e morfologicamente que infectam a mesma cepa bacteriana hospedeira e apresentam uma abrangência restrita de hospedeiros (em nível de cepas). Nossos resultados não publicados sugerem que a pilina do pilus tipo 4 (PilA) é o principal determinante para o ZC01, enquanto o ZC03 parece depender do LPS e da PilA para adsorção específica. As culturas de P. aeruginosa PA14 serão infectadas com ZC01 e/ou ZC03 e as alterações transcricionais no hospedeiro bacteriano serão acessadas de estágios iníciais até tardios da infecção lítica. As alterações transcricionais da PA14 infectada com ZC01 e/ou ZC03 serão acessadas em condições in vitro em que essa cepa bacteriana exibe fenótipo relacionado à virulência.