Desenvolvimento de plataforma automatizada para testes funcionais com tumoroides derivados de pacientes e geração de algoritmos de predição de resposta a quimioterapia.

• Processo: 24/02520-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2024
• Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2025
• Área de conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
• Pesquisador responsável: Vilma Regina Martins
• Beneficiário: Isadora Campos Rattes
• CNAE: Atividades de serviços de complementação diagnóstica e terapêutica
• Vinculado ao auxílio: 23/12853-0 - Aplicação de tumoroides na predição de resposta a terapia em oncologia de precisão funcional, AP.PIPE
• Assunto(s): Quimioterapia Oncologia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: quimioterapia | testes funcionais | tumoroides | Oncologia

Resumo

Uma grande limitação no tratamento do câncer avançado ou metastático é a alta taxa de resistência às medicações protocoladas (standard-ofcare). Cerca de 70% dos pacientes com doença avançada são candidatos à quimioterapia, e 50-60% deles têm pouca ou nenhuma resposta aotratamento. Por não existirem marcadores preditivos de resposta à quimioterapia, há um risco elevado do tratamento ser ineficaz. Ostumoroides derivados de pacientes são estruturas tridimensionais de complexidades morfológica e molecular semelhantes ao tecido tumoralde origem. Essas características abrem a possibilidade de seu uso para a realização de testes funcionais preditores da sensibilidade ou resistênciado paciente a agentes anti-tumorais. O uso de sistemas automatizados que permitam a realização de um grande número de análises é necessáriopara escalonar os testes funcionais para um número crescente de pacientes, e a validação analítica e clínica dos testes permitirá sua futuracomercialização. Na proposta do PIPE-2 solicitamos um sistema de automação Microlab Prep de 10 canais da Hamilton e um sistema de leiturade luminescência GM3510 GloMax Explorer System da Promega para esta finalidade.O bolsista TT4A desenvolverá e validará esta plataforma automatizada de 96 e 384 poços para análise do tratamento com quimioterápicosisolados e combinados de culturas de tumoroides gastrointestinais derivados de pacientes. A metodologia deve passar pelo desafio dapadronização do plaqueamento dos organoides (em número e posição em cada poço) e análises estatísticas que validem a robustez ereprodutibilidade da plataforma. Será necessário construir matrizes com curvas dose resposta de quimioterápicos individuais ou combinadospara tratamento dos tumoroides, uma vez que estas drogas são usadas em combinação no tratamento dos pacientes. A atividade destascombinações de quimioterápicos sobre a viabilidade dos tumoroides deve correlacionar-se com a resposta dos pacientes ao mesmo tratamento.Para validar ou não essa correlação será necessário um profissional qualificado que conheça métodos estatísticos de análise incluindo linguagemRF além de ser capaz de desempenhar metodologias experimentais complexas para a geração de tumoroides 3D. O bolsista atuará em conjuntocom o consultor Vinícius Calsavara na construção de análises multifatoriais, validação do modelo estatístico e na construção de algoritmos deanálise dos resultados do tratamento ex-vivo dos tumoroides e sua capacidade de predizer a resposta do paciente ao tratamento.