Identificação de RNAs longos não codificantes associados ao potencial tronco tumoral em câncer de pâncreas, glioblastoma e melanoma

• Processo: 24/02910-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2024
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2027
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética
• Pesquisador responsável: Eduardo Moraes Rego Reis
• Beneficiário: Daniela Bizinelli
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Aprendizado computacional Biologia computacional Células-tronco neoplásicas Expressão gênica Transcriptômica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Aprendizado Computacional | Biologia Computacional | Células-tronco tumorais | expressão gênica | Transcriptômica | Bioinformática

Resumo

Os cânceres de pâncreas, glioblastoma e melanoma representam desafios significativos na área oncológica, com taxas de mortalidade consideráveis e complexidades no manejo clínico. Apesar dos avanços na compreensão dos mecanismos tumorigênicos, a resistência terapêutica, especialmente relacionada às células-tronco tumorais (CSCs), continua a ser um obstáculo. Considerando o impacto dos RNAs longos não codificantes (lncRNAs) nos processos biológicos associados à manutenção das CSCs, este projeto propõe uma abordagem inovadora para explorar essas moléculas como alvos capazes de modular negativamente fenótipos malignos associados ao potencial tronco tumoral nesses tumores. As etapas metodológicas compreendem, principalmente, 1) aplicação de um modelo previamente publicado e validado de predição supervisionado para obter indicadores numéricos referentes ao potencial tronco de cada amostra tumoral avaliada; 2) identificação de lncRNAs diferencialmente expressos (DE) entre grupos de amostras caracterizados com baixo ou alto grau do potencial tronco tumoral; 3) investigação da expressão de lncRNAs associados ao "stemness" nos diferentes tipos celulares que compõe o microambiente tumoral e ao longo da trajetória de diferenciação de células tumorais utilizando dados de células únicas; e 4) avaliação da associação entre a expressão de lncRNA alvos e dados clínicos e de resposta ao tratamento. Dessa forma, visamos preencher lacunas na compreensão dos mecanismos moleculares subjacentes às CSCs e identificar novos alvos para o desenvolvimento de estratégias terapêuticas capazes de erradicar essas subpopulações de células tumorais e impedir a disseminação metastática e quimiorresistência em pacientes com cânceres agressivos.