Análise in silico de dados obtido pela tarefa SARS-Cov-2 durante o período de 2020 - 2022

• Processo: 24/08821-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2024
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2025
• Área de conhecimento: Interdisciplinar
• Pesquisador responsável: Paola Marcella Camargo Minoprio
• Beneficiário: Angélica Cristine Góes de Almeida Campos
• Instituição Sede: Institut Pasteur de São Paulo (IPSP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 17/27131-9 - Estratégia integrada para o estudo de agentes infecciosos causadores de doenças emergentes e/ou negligenciadas transmitidas por vetores de impacto global, AP.TEM
• Assunto(s): Comorbidade Emergência Análise in silico SARS-CoV-2
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Comorbidades | Emergência | In silico | SARS-CoV-2 | Microbiologia, virologia

Resumo

Entre 2020 e 2022, ao longo de dois anos de pesquisa, através do projeto temático 2017/27131-9, o IPSP se envolveu numa ação emergencial "SARS-CoV-2 na Região Metropolitana de São Paulo - Ação Emergencial". Durante este período pandêmico foram realizadas coletas de pacientes sintomáticos e assintomáticos para monitoramento dos pacientes positivos até a resolução completa da infecção, com o objetivo de ajudar no diagnóstico. Resumidamente, as amostras de triagem foram coletadas por meio de swabs nasofaríngeos e orofaríngeos. Em todas as coletas, foi aplicado um questionário para obter informações relacionadas ao paciente, como idade, local de residência, histórico de viagens, data de início dos sintomas, informações clínicas e laboratoriais e data de coleta da amostra. Para preservar a qualidade e a integridade das amostras coletadas, foram seguidas as recomendações da Agência Nacional de Vigilância Sanitária (ANVISA) para o transporte de material biológico humano para a realização de experimentos científicos. Quando os pacientes testavam positivos, foram acompanhados semanalmente, com a coleta subsequente de swabs nasofaríngeos, bem como amostras de sangue total e seus derivados, incluindo soro. Como resultado, conseguimos criar um grande biorrepositório com uma grande quantidade de informações clínicas e moleculares associadas a essas amostras. Pretendemos agora empregar esse biorrepositório em estudos com o objetivo de elucidar fenômenos biológicos que ocorreram durante a pandemia, mas que têm implicações para novas emergências virais. Assim, o acúmulo de dados (perto de 10.000 amostras) nos permite não só estudar a dinâmica do surgimento e da circulação do SARS-CoV-2 na cidade da Região Metropolitana de São Paulo (RMSP), como também apreciar outros parâmetros tais ligados à resistência e sensibilidade ao desenvolvimento de fases mais ou menos severas da doença, ao sexo, à idade, presença ou ausência de sintomas clínicos, co-morbidades, estratificação social, etc.