Sequenciamento do genoma total do Vírus da Necrose Infecciosa de Baço e Rim (ISKNV), obtido em tilápia (Oreochromis niloticus), cultivada no Estado de São Paulo/Brasil

• Processo: 24/13226-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2024
• Data de Término da vigência: 15 de dezembro de 2024
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Recursos Pesqueiros e Engenharia de Pesca - Aquicultura
• Pesquisador responsável: Cláudia Maris Ferreira Mostério
• Beneficiário: Guilherme Nunes Ferrez
• Supervisor: Thomas Barclay Waltzek
• Instituição Sede: Instituto de Pesca. Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). São Paulo , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Washington State University (WSU), Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 23/17337-0 - Detecção e caracterização de cepas circulantes de ISKNV (vírus da necrose infecciosa de baço e rim) no Estado de São Paulo, BP.MS
• Assunto(s): Biologia molecular Genômica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biologia molecular | Genômica | Isknv | Sanidade de Organismos Aquáticos | Biologia Molecular

Resumo

A aquicultura tem crescido significativamente, com a produção mundial de pescado alcançando 185 milhões de toneladas em 2022. No entanto, o aumento da produção em sistemas intensivos tem aumentado a disseminação de patógenos, como o vírus da necrose infecciosa de baço e rim (ISKNV). Esse vírus pertence à família Iridoviridae e está associado a três genótipos: RSIV, TRBIV, e ISKNV. O objetivo principal deste estudo é sequenciar o genoma completo de cepas de ISKNV em tilápias de pisciculturas no Estado de São Paulo e determinar a relação filogenética com outras linhagens descritas na literatura. Para tanto, amostras de alevinos de tilápia foram coletadas de cinco pisciculturas em São Paulo entre o outono de 2023 e a primavera de 2024. As amostras de baço e rim foram extraídas, e o DNA foi isolado e amplificado utilizando PCR convencional. As amostras positivas foram sequenciadas pelo método Sanger. Para entender a filogenia e as inter-relações deste vírus, pretende-se realizar o sequenciamento do genoma completo utilizando técnicas de última geração disponíveis na WSU. As sequências serão analisadas filogeneticamente e comparadas com outras descritas na literatura. Entre as atividades previstas, incluem-se melhorar técnicas de qPCR, isolamento viral e sequenciamento de nova geração, bem como realizar treinamentos em análises evolutivas e estudos de polimorfismo. A importância do estudo reside no fato de que o sequenciamento de genomas virais ser crucial para a compreensão da epidemiologia do ISKNV, ajudando a identificar variantes genéticas e a diversidade de cepas, o que é fundamental para mitigar os impactos na tilapicultura e nos ecossistemas naturais. (AU)