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Estudos in silico de interação de peptídeos antimicrobianos com proteínas de microrganismos por abordagens de "Target Fishing" e "Docking"

Processo: 24/09317-1
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Vigência (Início): 01 de outubro de 2024
Vigência (Término): 30 de setembro de 2025
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica
Pesquisador responsável:Katia da Conceição
Beneficiário:Gabriele Santos Cepinho
Instituição Sede: Instituto de Ciência e Tecnologia (ICT). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São José dos Campos. São José dos Campos , SP, Brasil
Assunto(s):Catepsinas   Análise in silico   Peptídeos catiônicos antimicrobianos
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:catepsinas | Cecropina | In silico | peptídeos antimicrobianos | Bioquímica de peptídeos

Resumo

Infecções causadas por bactérias resistentes a antibióticos estão entre as principais causas de morte de pessoas de todas as idades, segundo estudo global sobre resistência antimicrobiana (AMR). Peptídeos e peptidomiméticos ressurgem como candidatos no desenvolvimento de estratégias terapêuticas devido à sua especificidade e baixa toxicidade. Nesse contexto, uma estratégia para o projeto e otimização de peptídeos/peptidomiméticos combina abordagens computacionais, desde bioinformática estrutural até simulações atomísticas. No presente projeto, novos peptídeos desenhados a partir das sequências de cecropinas e catepsinas com potencial atividade de amplo espectro e penetração celular serão investigados quanto a sua capacidade de ligação com proteínas. Um sistema guiado por banco de dados computacional de análise e modificação racional será utilizado para otimizar a estrutura desses peptídeos, visando melhorar sua eficácia e seletividade. Serão então investigados, por meio do método de "pesca de alvo" ("target fishing"), os possíveis alvos moleculares proteicos de ligação com os peptídeos selecionados, utilizando diferentes servidores da Web. A estabilidade e afinidade de ligação peptídeo-proteína alvo serão avaliadas por meio de avaliação de interação ("docking") molecular. Com base nas informações obtidas, será conduzida uma análise aprofundada com base na literatura, visando categorizar e examinar os alvos identificados e entender melhor os mecanismos envolvidos nas atividades dos peptídeos selecionados.

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