Mapeamento das vias do metabolismo de ácidos siálicos bacterianas em dados de sequenciamento de doenças inflamatórias intestinais

• Processo: 24/06686-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2024
• Data de Término da vigência: 31 de outubro de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Lívia Soares Zaramela
• Beneficiário: Dorivaldo Marques da Silva Junior
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 20/08554-9 - Estabelecimento de uma plataforma experimental e computacional para o estudo das interações entre microrganismos e hospedeiro mediadas por ácidos siálicos, AP.JP
• Assunto(s): Ácidos siálicos Biologia computacional Clostridium difficile Doenças inflamatórias intestinais Metagenômica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Ácidos siálicos | bioinformática | Clostridium difficile | doenças inflamatórias intestinais | metagenômica | Bioinformática

Resumo

As doenças inflamatórias intestinais (IBD) e a infecção por Clostridium difficile (CDI) são condições de alta gravidade que vem se expandido em diversas regiões do planeta, sendo que ambas vêm sendo associadas a situação de disbiose da flora intestinal. Um conjunto de moléculas de grande relevância na dinâmica intestinal é o dos ácidos siálicos, um grupo diverso de monossacarídeos carboxilados encontrados na extremidade de cadeias de carboidratos e glicoconjugados associados a lipídios. É sabido que os ácidos siálicos participam de processos patológicos, pois atuam como sítios de ligação para patógenos e toxinas. Além disso, certas bactérias têm a capacidade  de utilizá-los como fonte de carbono e nitrogênio, podem apresentá-los em sua superfície, dessa forma escapando da resposta imunológica, ou são capazes de alterá-los através de vias metabólicas de forma a concedê-los novas características. Estudos mostram que a composição da microbiota intestinal, desde o nascimento, é influenciada pela ingestão de oligossacarídeos contendo ácidos siálicos. Além disso, já foi mostrado que a ação de sialidases impulsiona o crescimento bacteriano, colaborando para a disbiose em um contexto de inflamação intestinal. Por fim, já foi observada a colaboração entre microrganismos capazes de liberar os ácidos siálicos e patógenos. Essas observações justificam a investigação do papel dos ácidos siálicos e proteínas relacionadas nos processos de IBD e CDI. Existem diversos trabalhos em que dados passíveis dessa análise foram produzidos, mas não estudados com esse enfoque. Assim, tem-se como objetivo analisar dados de metagenômica em busca de proteínas envolvidas no transporte e metabolismo de ácidos siálicos.