Integração Ômica dos Vilos Coriônicos Placentários em Mulheres Grávidas com Câncer de Mama em Tratamento com Quimioterapia

• Processo: 24/15577-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Mestrado
• Data de Início da vigência: 27 de janeiro de 2025
• Data de Término da vigência: 26 de julho de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Fisiologia - Fisiologia de Órgãos e Sistemas
• Pesquisador responsável: Laís Rosa Viana
• Beneficiário: Rafaella Trevisan Scandiuzzi
• Supervisor: Olivier e Pardo
• Instituição Sede: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Imperial College London, Inglaterra
• Vinculado à bolsa: 23/09681-2 - Análise do Perfil Proteômico Placentário de Gestantes com Câncer de Mama Submetidas à Quimioterapia, BP.MS
• Assunto(s): Integração Placenta Quimioterapia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Câncer de mama durante a gestação (PrBC) | Integração | Omica | placenta | quimioterapia | Gravidez e Câncer

Resumo

Câncer é uma questão significativa de saúde pública global devido às suas altas taxas de mortalidade, com aproximadamente 20 milhões de novos casos em 2022. O câncer de mama é o mais comum entre as mulheres, e houve um aumento nos diagnósticos entre mulheres mais jovens, incluindo durante a gravidez. O câncer de mama durante a gravidez associado à quimioterapia pode levar a alterações na placenta, resultando em restrição de crescimento intrauterino e parto prematuro. Apesar do papel fundamental da placenta no contexto da gravidez, pouco se sabe sobre os mecanismos moleculares que são alterados no contexto do câncer de mama durante a gravidez (PrBC) e o tratamento quimioterápico. Para ter uma visão holística e entender melhor as vias moleculares que poderiam estar envolvidas nas alterações da placenta relacionadas ao PrBC, a integração de análises ômicas combinadas com dados clínicos é essencial. Portanto, o objetivo deste projeto é realizar análises integradas de proteômica e metabolômica em placentas de pacientes com PrBC submetidas à quimioterapia e comparar esses resultados com os perfis ômicos integrados de placentas de gestações de baixo risco (grupo controle). Para atingir esse objetivo, o projeto Jovem Pesquisador (2021/08931-0) tem parcerias com o CAISM e o LNBIO (CNPEM). No CAISM, as placentas de pacientes com PrBC e do grupo controle foram coletadas e armazenadas, enquanto no LNBIO, análises metabolômicas estão sendo realizadas usando o espectrômetro de RMN Varian Inova 600Hz (Agilent Technologies Inc., Santa Clara, CA, EUA). A análise proteômica está sendo realizada usando um UPLC nano bidimensional (2D-RP/RP) em um Sistema Acquity UPLC M-Class (Waters Corporation, MA, EUA), que está conectado em linha a um espectrômetro de massa Synapt G2-Si (Waters Corporation). O espectrômetro de massa executa Aquisições Independentes de Dados, especificamente empregando Espectrometria de Massa Independente de Dados de Ultra-definição (UDMSE). Os próximos passos de limpeza, formatação, integração (usando R) e enriquecimento biológico desses dados fazem parte do projeto BEPE, que será realizado em Londres, no Imperial College, em colaboração com o grupo do Dr. Oliver Pardo, uma equipe líder em integração ômica. Portanto, a limpeza e formatação desses dados serão realizadas. Uma lista de proteínas diferencialmente expressas (DEPs) e metabólitos diferencialmente expressos (DEMs) entre as condições será gerada através de análise estatística usando ANOVA com correção para comparações múltiplas (método de taxa de descoberta falsa). As DEPs passarão por uma análise de rede de interação funcional multivariada estática usando o ReactomeFIViz (Cytoscape). Além disso, o enriquecimento de vias será realizado para subsequente integração com os DEMs. A correspondência entre DEMs e DEPs será visualizada sobrepondo-os no mapa metabólico da base de dados HumanCyc. Além disso, possíveis alterações na atividade dos fatores de transcrição que possam explicar as DEPs serão inferidas usando o iRegulon. Finalmente, a análise de correlação entre DEPs/DEMs e os dados clínicos associados aos conjuntos de dados será realizada.