Potencial de regulação de lncRNAs no metabolismo lipídico hepático de suínos alimentados com diferentes níveis e fontes de óleo

• Processo: 24/19019-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2025
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Aline Silva Mello Cesar
• Beneficiário: Bruna Pereira Martins da Silva
• Supervisor: Wellison Jarles da Silva Diniz
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Auburn University, Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 22/10780-2 - Potencial de regulação de lncRNA no metabolismo lipídico do músculo e fígado de suínos alimentados com diferentes níveis e fontes de óleo, BP.DR
• Assunto(s): Biologia de sistemas RNA longo não codificante Modelos animais Suínos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: biologia de sistemas | LncRNA | Metabolismo de Lipídios | Modelo Animal | Suínos | Genômica Funcional e Nutrigenômica

Resumo

Os lipídios atuam como moléculas sinalizadoras, participam em vários processos e são essenciais para todos os tipos de células. O fígado é um dos principais tecidos responsáveis pelo metabolismo dos lipídios, um processo complexo e dinâmico que envolve vários reguladores transcricionais. Os lncRNAs desempenham papéis fundamentais no metabolismo dos lipídios e têm sido amplamente estudados em modelos animais como o suíno. Os objetivos do presente estudo são identificar vias, redes e módulos de co-expressão associados aos lncRNAs e ao metabolismo lipídico e investigar o potencial regulador destes lncRNAs, utilizando dados do transcriptoma do fígado de suínos alimentados com diferentes níveis e fontes de óleo. Para este estudo, serão utilizados dados de 72 suínos machos de um período experimental de 98 dias. Os tratamentos experimentais consistiram em dietas à base de milho e farelo de soja contendo 1,5% de óleo de soja (SOY1.5), ou 3,0% de óleo de soja (SOY3.0), ou 3,0% de óleo de canola (CO), ou 3,0% de óleo de peixe (FO). Os lncRNAs foram identificados, quantificados e anotados a partir dos dados de RNA-Seq (n = 72). Os resultados obtidos foram usados para análise de expressão diferencial usando o DESeq2. A associação com os fenótipos de interesse (perfil de ácidos gordos e eficiência energética animal) será estimada através da construção de redes de co-expressão a partir dos dados de RNA-Seq com os transcritos normalizados por milhões (TPM), utilizando o pacote R Weighted Correlation Network Analysis (WGCNA). Análises de enriquecimento funcional e análises de redes e vias de genes dos módulos de co-expressão contendo lncRNAs correlacionados com o perfil de ácidos graxos e eficiência energética animal serão realizadas utilizando o plug-in ClueGO do Cytoscape e o ShinyGO. Os resultados esperados deste estudo têm um perfil tecnológico e inovador, uma vez que podem fornecer uma compreensão mais profunda dos processos que ligam os lncRNAs ao metabolismo lipídico, utilizando os suínos como um modelo animal relevante.