Citogenômica comparativa em sapos: Reorganização genômica e evolução de cromossomos sexuais múltiplos.

• Processo: 24/19003-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2025
• Data de Término da vigência: 31 de outubro de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: Marcelo de Bello Cioffi
• Beneficiário: Jhon Alex Dziechciarz Vidal
• Supervisor: Qi Zhou
• Instituição Sede: Centro de Ciências Biológicas e da Saúde (CCBS). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). São Carlos , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Zhejiang University, China
• Vinculado à bolsa: 23/06898-0 - Origem e diferenciação de cromossomos sexuais: O sistema XX/XY convencional e suas formas derivadas. Análises comparativas em espécies de insetos, peixes e anfíbios, BP.DR
• Assunto(s): Anfíbios Biologia computacional Cromossomos sexuais Evolução Genômica Citogenômica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Anfíbios | bioinformática | Citogenômica Comparativa | Cromossomos sexuais | Evolução | Genômica | Citogenômica

Resumo

Os Anura representam o grupo de vertebrados com o maior número de cromossomos sexuais múltiplos atípicos derivados de translocações envolvendo os autossomos e os cromossomos sexuais, que se manifestam como multivalentes em forma de cadeia ou anel durante a meiose. Tais casos são observados em espécies do gênero Odorrana (Ranidae) e Leptodactylus (Leptodactylidae), apesar de terem divergido há pelo menos 135 Mya. O sapo Odorrana swinhoana exibe um hexavalente em forma de anel formado por seis cromossomos durante a meiose dos machos, indicando um sistema de cromossomos sexuais X1-X5/Y1-Y5. No gênero Leptodactylus, uma grande cadeia meiótica em forma de anel semelhante é observada em pelo menos duas espécies (L. pentadactylus e L. paraensis), embora em estado polimórfico em relação ao número de cromossomos envolvidos, que varia entre oito, dez e doze. Este projeto BEPE pretende conduzir investigações citogenômicas comparativas para verificar a hipótese de que esses rearranjos cromossômicos podem ter ocorrido de forma não aleatória e examinar se os pontos de quebra associados à origem desses multivalentes em forma de anel foram compartilhados convergentemente em ambas as espécies. As atividades propostas incluem: i) treinamento imersivo do estudante em análise bioinformática para montagem e anotação do genoma; ii) identificação das regiões translocadas implicadas na formação multivalente em forma de anel de Odorrana swinhoana; iii) análise de assinaturas de seleção nas regiões rearranjadas; iv) desenvolvimento de sondas baseadas em oligonucleotídeos específicos para essas regiões; e v) realização de análises genômicas comparativas em Odorrana e Leptodactylus para a identificação grupos de ligação ancestrais (ALG). O Prof. Qi Zhou (Universidade de Zhejiang, China) foi selecionado como supervisor porque é um especialista global em genômica animal e fornecerá ao aluno treinamento e experiência de alta qualidade na aplicação de técnicas genômicas de ponta usadas para ensaios genômicos comparativos. Esta experiência de treinamento será significativamente relevante para o avanço do aluno e para as futuras pesquisas conduzidas em nosso laboratório, que está progressivamente integrando análises genômicas com investigações cromossômicas dentro do campo emergente da citogenômica.