Assinatura de microbioma fecal para a detecção precoce do câncer colorretal em suas lesões precursoras.

• Processo: 24/14952-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2025
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Rui Manuel Vieira Reis
• Beneficiário: Mariana Bisarro dos Reis
• Supervisor: Jeremy Wang
• Instituição Sede: Hospital do Câncer de Barretos. Fundação Pio XII (FP). Barretos , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: University of North Carolina at Chapel Hill (UNC), Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 21/13861-0 - Perfil microbioma fecal como biomarcador de detecção precoce em Câncer Colorretal em biópsia líquida, BP.PD
• Assunto(s): Biologia computacional Neoplasias colorretais Diagnóstico precoce Microbiota
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bioinformática | Câncer Colorretal | diagnóstico precoce | lesão precursora | microbioma | sequenciamento MinION | Genética

Resumo

O câncer colorretal (CCR) é um grande problema de saúde global, com altas taxas de mortalidade devido ao diagnóstico em estágio avançado. Programas de rastreamento usando testes de sangue oculto nas fezes e colonoscopia visam detectar lesões precursoras e CCR quando o tratamento curativo é viável. No entanto, esses métodos têm limitações, incluindo sensibilidade variável do teste de sangue oculto e caráter invasivo da colonoscopia. O microbioma intestinal surgiu como um potencial biomarcador não invasivo para a detecção precoce de CCR. Este projeto irá avaliar o impacto molecular e clínico do microbioma intestinal e seu papel como biomarcador para a detecção precoce de CCR e suas lesões precursoras. Será utilizada a terceira geração de NGS, a tecnologia MinION com leitura de reads longas, em amostras de fezes residuais preservadas em tubo de Teste de Sangue Oculto nas Fezes (FIT). A análise dos dados de sequenciamento será feita em colaboração com o Dr. Jeremy Wang, especialista em sequenciamento de microbioma e biologia computacional da Universidade da Carolina do Norte. Amostras de fezes de participantes do programa de rastreamento de CCR de Barretos que tiveram testes FIT positivos e foram submetidos à colonoscopia diagnóstica serão avaliadas. Serão incluídos 100 participantes sem lesões e 100 participantes com lesões precursoras ou câncer. O gene 16S rRNA do DNA microbiano será sequenciado usando o 16S Barcoding Kit e MinION (Nanopore). As análises bioinformáticas incluirão controle de qualidade das sequências, atribuição taxonômica, métricas de diversidade e exploração de vias funcionais. Pretendemos identificar assinaturas do microbioma como biomarcadores para a detecção precoce de CCR na população brasileira. A integração da tecnologia de sequenciamento Nanopore e bioinformática avançada promete novos insights sobre a patogênese do CCR, potencialmente impactando o rastreamento e diagnóstico precoce e melhorando o resultado do tratamento dos pacientes.