Visualização de interações celulares entre células Tregs e outros tipos celulares no intestino de pacientes com doença de Crohn

• Processo: 25/00092-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2025
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Imunologia - Imunologia Aplicada
• Pesquisador responsável: Raphael Sanches Peres
• Beneficiário: Maria Eduarda Monteiro Garcia
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 23/17817-1 - Identificação de interações celulares que afetam a função de células t reguladoras em doenças inflamatórias intestinais, AP.JP
• Assunto(s): Linfócitos T reguladores Doenças inflamatórias intestinais Imunologia celular Inflamação Comunicação celular Imunofarmacologia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Células T reguladoras | doenças inflamatórias intestinais | Imunologia celular | Inflamação | interações celulares | Transcriptoma Espacial | Imunofarmacologia

Resumo

As doenças inflamatórias intestinais (DIIs), que incluem a doença de Crohn (DC) e a retocolite ulcerativa (RCU), são um grupo de condições inflamatórias crônicas que afetam o trato gastrointestinal. Devido a falta de um melhor entendimento relacionado aos mecanismos moleculares e celulares envolvidos na patogênese das DIIs, o tratamento das DIIs ainda é um desafio para os clínicos. Recentemente, o sequenciamento de RNA em nível de célula única (scRNA-seq) forneceu informações relevantes sobre a composição e heterogeneidade celular do intestino e da circulação de pacientes com DII, identificando novos módulos celulares e assinaturas gênicas ligadas à resistência ao anti-TNF, primeira linha de biológicos utilizados no tratamento de DIIs. Porém, esta caracterização é limitada em resolução para caracterizar populações celulares encontradas em baixos números/frequências no tecido e na circulação, como subconjuntos de T reguladoras (Tregs). Além disso, apesar desta abordagem caracterizar a diversidade de células presentes no tecido à nível de célula única, ela não permite determinar a organização espacial tecidual e como ocorrem as interações entre as células no intestino. Visando elucidar esses aspectos, nosso grupo de pesquisa conduzirá experimentos de transcriptoma espacial, que além de fornecer uma base de dados de transcriptoma completo com resolução de célula única, também proporcionará uma caracterização de como as células Tregs se organizam e interagem com outros tipos celulares no tecido. Os dados obtidos através dos experimentos de transcriptoma espacial serão explorados e validados no nosso laboratório. No presente projeto, o objetivo será validar os achados obtidos através dos experimentos de transcriptoma espacial utilizando a técnica de imunofluorescência (IF) utilizando amostras de biopsias intestinais de pacientes com DC coletadas prospectivamente (antes e após a terapiacom anti-TNF). Simultaneamente à IF em amostras de humanos, também conduziremos marcações para IF dos alvos identificados em secções de cólon de camundongos com colite, tratados ou não com anti-TNF, submetidos ao modelo de colite induzida por transferência de células T naive em animais Rag1-/-. A demonstração de que as interações celulares identificadas em humanos também ocorrem em modelo experimental será essencial para fornecer evidências para o desenvolvimento de novas estratégias para intervenção terapêutica através de testes em modelos experimentais de inflamação intestinal.