Análise do microbioma oral em indivíduos em uso de profilaxia pré-exposição (PrEP) ao vírus da imunodeficiência humana (HIV)

• Processo: 24/23762-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2025
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2026
• Área de conhecimento: Ciências da Saúde - Odontologia - Clínica Odontológica
• Pesquisador responsável: Paulo Henrique Braz da Silva
• Beneficiário: Nilson Ferreira de Oliveira Neto
• Supervisor: Roger Junges
• Instituição Sede: Faculdade de Odontologia (FO). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: University of Oslo (UiO), Noruega
• Vinculado à bolsa: 23/14978-4 - Análise de biomarcadores salivares e do microbioma/viroma oral de pacientes diagnosticados com sífilis, BP.DR
• Assunto(s): Saliva RNA ribossômico 16S
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: oral microbiome | Pre-exposure Prophylaxis | saliva | 16S rRNA | Patologia Oral e Maxilofacial

Resumo

A saliva é um fluido biológico valioso para a identificação de biomarcadores, incluindo microrganismos com potencial de infectividade. Sua coleta é acessível, rápida e minimamente invasiva, o que a torna um meio ideal para estudos diagnósticos. A profilaxia pré-exposição (PrEP) para o vírus da imunodeficiência humana (HIV) envolve o uso de medicamentos antirretrovirais para reduzir o risco de infecção. Embora estudos anteriores tenham demonstrado que a PrEP oral pode desregular o microbioma intestinal, seu impacto sobre o microbioma oral permanece inexplorado. Como os usuários de PrEP frequentemente permanecem em profilaxia por longos períodos, compreender essas alterações é essencial para orientar formuladores de políticas e profissionais de saúde. Este estudo tem como objetivo caracterizar o microbioma oral de usuários de PrEP por meio do perfilamento baseado em 16S rRNA, com foco na dinâmica e na diversidade genética dos microrganismos na cavidade oral. Amostras de saliva foram coletadas durante o exame inicial e em visitas de acompanhamento ao longo de um período de 12 meses, sendo posteriormente armazenadas a ¿80°C até a análise. O perfilamento do microbioma incluirá o sequenciamento de 16S rRNA bacteriano, com os dados brutos processados utilizando os pipelines DADA2 e Phyloseq. A interpretação e a visualização dos dados serão realizadas com pacotes do R e ferramentas integradas, como o Microbiome Analyst. Análises diferenciais, incluindo comparações de composição do microbioma e da diversidade alfa e beta, serão priorizadas para identificar diferenças significativas entre os grupos.