Análise de dados do comportamento espaço-temporal em células individuais: métodos para tubos polínicos

• Processo: 25/01581-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2025
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Botânica
• Pesquisador responsável: Maria Teresa Portes
• Beneficiário: Arthur Fernandes Stradiotto Marcusse
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 19/26129-6 - A saga de um tubo polínico para encontrar o óvulo: regulação iônica espaço-temporal como mecanismo de crescimento apical e direcionamento em células individuais, AP.JP
• Assunto(s): Crescimento celular Fenotipagem Oscilações Análise de séries temporais
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: crescimento celular | Fenotipagem | Oscilacões | Séries Temporais | Tubos Polínicos | Biologia Celular e Desenvolvimento

Resumo

Análises de séries temporais de dados e de imagens são cruciais para o entendimento do comportamento de células individuais. Entretanto, os experimentos geralmente geram uma quantidade de dados muito superior àquela que as técnicas convencionais de análises de dados são capazes de processar, gerando uma "inundação de dados". Uma ampla base de dados de séries temporais de tubos polínicos crescendo in vitro foi gerada, contendo medidas de fluxos extracelulares e concentrações intracelulares de múltiplos íons, incluindo cálcio (Ca2+), prótons (H+) e cloreto (Cl-), em pelo menos 4 espécies (Arabidopsis, lírio, tabaco e tomate). Adicionalmente, as aquisições de séries temporais com medidas não invasivas, com até duas variáveis, externa e interna, e crescimento apical na mesma célula, foram medidas em tubos polínicos de vários ecótipos de Arabidopsis thaliana, tais como Col-0, WS, C24, CVI e em diversos mutantes no background Col-0. Esta coleção única de mais de 2000 séries temporais, com aquisições de até 1 h (900 pontos), tem o potencial de revelar múltiplas assinaturas do fenômeno oscilatório observado em tubos polínicos, e podem contribuir para elucidar a sua suposta função biológica.