Bolsa 24/22312-9 - Análise de sequência de RNA, Regulação da expressão gênica - BV FAPESP
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ANÁLISE DE PERFIS TRANSCRICIONAIS DE Xanthomonas citri pv. citri EM CONDIÇÕES RELEVANTES PARA A INFECÇÃO DE PLANTAS

Processo: 24/22312-9
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de abril de 2025
Data de Término da vigência: 29 de fevereiro de 2028
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:Cristina Elisa Alvarez Martinez
Beneficiário:Brenno Wendler Miranda
Instituição Sede: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:21/10577-0 - Centro de Pesquisa em Biologia de Bactérias e Bacteriófagos (CEPID B3), AP.CEPID
Assunto(s):Análise de sequência de RNA   Regulação da expressão gênica
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:RNA-seq | T2Ss | T3Ss | Xanthomonas citri pv citri | Regulação da expressão genica

Resumo

Xanthomonas citri pv citri (Xcc) é a bactéria causadora do cancro cítrico, doença que acomete diversas espécies de plantas do gênero Citrus e causa prejuízos para produtores. No processo de infecção de plantas, diversas condições são encontradas por patógenos e mecanismos foram selecionados para lidar com adversidades. Neste processo, é de especial relevância os diferentes tipos de sistemas de secreção, que conferem vantagens na competição contra outros organismos da microbiota local, bem como auxiliam no processo de infecção do hospedeiro. Neste sentido, o sistema de secreção do tipo 3 (T3SS) tem papel fundamental na virulência deste organismo, pois modula o metabolismo da célula vegetal para contornar a resposta imune e até mesmo ativar a expressão de genes da planta para garantir a sobrevivência do patógeno. O T3SS é codificado pelos genes hrp, que são regulados pelos reguladores HrpG e HrpX. Alguns mecanismos da regulação de HrpG já foram descritos, como modificações pós-traducionais e controle traducional e pós-traducional. Também já foram descritos genes que são essenciais para a virulência, mas cuja relação com a regulação da expressão gênica de hrp ainda não foi estabelecida. No entanto, pouco se sabe acerca de sinais ambientais encontrados pelas bactérias que desencadeiam a expressão de genes relacionados com a virulência. Com exceção dos componentes presentes na formulação de determinados meios mínimos que simulam o apoplasto, há uma limitação no conhecimento de sinais ambientais responsáveis pela ativação do T3SS e a resposta transcricional de Xcc a esses sinais. Desta forma, este projeto objetiva a construção de sensores genéticos baseados em elementos regulatórios do T3SS para a realização de um screening de alto rendimento utilizando 576 condições de cultivo para a avaliação de sinais capazes de ativar a expressão desse sistema. Com as condições de indução do T3SS identificadas, será realizado o RNA-seq para descrever o perfil transcricional de Xcc em condições relevantes para a infecção. Com isso, espera-se elucidar mecanismos de adaptação ao hospedeiro e aos ambientes encontrados pela bactéria.

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