Sequenciamento e mineração de genomas de cianobactérias brasileiras visando identificar clusters de genes biossintéticos

• Processo: 25/02439-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2025
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Química - Química Orgânica
• Pesquisador responsável: Camila Manoel Crnkovic
• Beneficiário: Lígia Akemi Mizuyama
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas (FCF). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 22/02872-4 - Estratégias integradas para a descoberta de produtos naturais de cianobactérias brasileiras, AP.PNGP.PI
• Assunto(s): Biologia computacional Biossíntese Mineração de genoma Produtos naturais Química de produtos naturais
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | Biossintese | mineração genômica | Produtos Naturais | Química de Produtos Naturais

Resumo

Produtos naturais são uma fonte reconhecida de compostos que inspiram a descoberta e o desenvolvimento de fármacos. Metabólitos secundários de cianobactérias têm demonstrado grande potencial para aplicações biotecnológicas e médicas, incluindo compostos com propriedades antivirais, antifúngicas e antiproliferativas. No entanto, os produtos naturais de cianobactérias brasileiras ainda são pouco estudados. Com a expansão da bioinformática e os avanços nas técnicas de sequenciamento de genomas, a análise de clusters de genes biossintéticos (BGCs, do inglês biosynthetic gene clusters), por meio da mineração genômica, surge como uma estratégia promissora na prospecção de novos compostos. Em um projeto anterior, nosso grupo de pesquisa desenvolveu um método sistemático para priorizar BGCs com base em genomas cianobacterianos previamente estudados, auxiliando na descoberta de potenciais metabólitos secundários. O presente projeto visa utilizar a mineração genômica para analisar sequências de genomas de cianobactérias brasileiras, identificando e priorizando clusters de genes biossintéticos. O nosso primeiro objetivo é extrair, sequenciar e minerar novos genomas de cianobactérias do Brasil em busca de BGCs promissores. O segundo objetivo é implementar o algoritmo de priorização de BGCs em Python, buscando uma ferramenta mais acessível para a comunidade científica. Esse algoritmo será testado com genomas de cianobactérias brasileiras disponíveis publicamente.