Vigilância genômica de patógenos bacterianos de prioridade crítica em infecção do trato urinário de origem hospitalar e comunitária

• Processo: 24/21733-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2025
• Data de Término da vigência: 10 de setembro de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
• Pesquisador responsável: Nilton Erbet Lincopan Huenuman
• Beneficiário: Gabrielle Rocha Pereira
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Farmacorresistência bacteriana Saúde Única Vigilância genômica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: infecção nosocomial | Resistência Bacteriana | Saúde Única | Vigilância genômica | Resistência Bacteriana

Resumo

A emergência e disseminação de patógenos resistentes a múltiplos antimicrobianos é um problema de saúde pública global, não estando restrito ao ambiente hospitalar e é uma das demandas da Saúde Única. Este projeto visa investigar a presença de patógenos bacterianos de prioridade crítica, definidos pela Organização Mundial da Saúde (OMS), como espécies de importância clínica produtoras de beta-lactamases de espectro estendido (ESBL) e/ou carbapenemases (KPC, NDM), em uroculturas de pacientes com diagnóstico de infecção urinária hospitalar, no estado de São Paulo. Neste projeto, trabalharemos com isolados bacterianos Gram-negativos (Escherichia coli e Klebsiella pneumoniae) recuperados de pacientes com infecção urinária hospitalar (ITUH). Os isolados serão encaminhados por instituições parceiras. Serão utilizados protocolos já estabelecidos para isolamento e estoque. Os isolados bacterianos serão identificados por MALDI-TOF, e o perfil de sensibilidade será obtido por meio de antibiograma qualitativo (disco-difusão) e/ou quantitativo (MIC), conforme padronizado pelo CLSI e BrCAST. Os dados genômicos de interesse clínico e epidemiológico (resistoma, mobiloma, viruloma, MLST) serão obtidos após sequenciamento das cepas de interesse usando a plataforma Illumina NextSeq2000. Toda a informação será publicamente disponibilizada na plataforma OneBR (http://www.onehealthbr.com/). Os resultados deste estudo contribuirão com dados de vigilância epidemiológica para o manejo, tratamento, e desenvolvimento de estratégias de controle da disseminação de patógenos bacterianos resistentes aos antibióticos clinicamente importantes na interface humana, e com a formação científica da candidata.