Análises genéticas (Citogenética, SANGER e Genômicas) e gerenciamento do laboratório molecular

• Processo: 25/20658-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2025
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2027
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: Alexandre Reis Percequillo
• Beneficiário: Ana Lazar Gomes e Souza
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 20/11444-0 - Diversidade de roedores neotropicais (Rodentia: Sciuridae, Cricetidae, Echimyidae): origem, evolução e biogeografia, AP.TEM
• Assunto(s): Cariótipo Filogenia Rodentia Sequenciamento Sistemática
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cariótipo | Citocromo b | Filogenia | Rodentia | sequenciamento | Sistematica | Citogenética, Filogenia molecular

Resumo

As amostras coletadas nas expedições do projeto Temático "Diversidade de Roedores Neotropicais (Rodentia: Sciuridae, Cricetidae, Echimyidae): Origem, Evolução e Biogeografia" serão preparadas no laboratório para sequenciamento Sanger e de Nova Geração, Genômico. Em um primeiro momento as amostras serão sequenciadas para os marcadores moleculares mitocondriais citocromo b (citb) e citocromo oxidase subunidade I (COI). As sequências geradas serão analisadas através de abordagens filogenéticas e populacionais para identificação preliminar das amostras e detecção de questões a serem aprofundadas. A partir destas análises, as amostras serão selecionadas para o sequenciamento de Nova Geração. O bolsista será também treinado para a confecção das bibliotecas para o sequenciamento genômico. Adicionalmente, bolsista será responsável pela preparação dos cariótipos de todas as espécies em laboratório. A citogenética é uma ferramenta complementar para auxiliar na identificação das espécies e entender a diversidade genética de cada táxon. Por estas razões, pretendemos contratar um bolsista TT-V que tenha experiência para conduzir as práticas laboratoriais e realizar as análises moleculares e citogenéticas preliminares das amostras coletadas. O bolsista irá ainda ensinar e auxiliar os bolsistas de IC e PG nas técnicas de laboratório e no desenvolvimento de seus projetos, além de auxiliar no gerenciamento e manutenção do laboratório molecular.