Desvendando a comunidade microbiana e a matéria escura funcional em wetlands Amazônicos: integrando sequenciamento do gene 16S rRNA, genoma montado a partir de metagenoma e modelo de linguagem de proteínas.

• Processo: 26/06590-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 14 de setembro de 2026
• Data de Término da vigência: 13 de janeiro de 2027
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
• Pesquisador responsável: Gustavo Maruyama Mori
• Beneficiário: Vinícius Tesch Mazotti
• Supervisor: Rebecca Vega Thurber
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB-CLP). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus Experimental do Litoral Paulista. São Vicente , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: University of California, Santa Barbara (UC Santa Barbara), Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 24/21564-4 - Como microrganismos produtores e consumidores de metano se distribuem nas planícies alagáveis amazônicas: Uma abordagem molecular e biogeoquímica, BP.IC
• Assunto(s): Amazônia Microbiologia do solo Ecologia microbiana
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Amazonia | ciclo do metano | Metagenome-Assembled Genome (MAGs) | Microbiologia do solo | Modelos de linguagem de proteínas (PLMs) | Sequencimento 16S rRNA | Ecologia microbiana

Resumo

Os ciclos biogeoquímicos em ecossistemas naturais são fortemente controlados por comunidades procarióticas. Identificar a composição taxonômica e o potencial funcional dos organismos em uma comunidade procariótica permite compreender as redes de coocorrência, como eles interagem entre si e quais vias estão efetivamente disponíveis para processos biogeoquímicos, como a produção e o consumo de metano (CH4). O sequenciamento completo e de amplicons do rRNA 16S, integrado a genomas montados a partir de metagenomas (MAGs), é uma abordagem poderosa para conectar a estrutura da comunidade procariótica ao seu potencial funcional. Além disso, os modelos de linguagem de proteína (PLMs) emergiram como uma ferramenta para possibilitar a descoberta de novas proteínas, genes e metabolismos em ecossistemas complexos. Aqui, nosso objetivo é descrever a composição de espécies e o potencial funcional das comunidades procarióticas de áreas úmidas no leste da Amazônia. A integração dessas técnicas com os dados biológicos e ambientais já coletados nos permitirá obter uma compreensão mais profunda sobre a distribuição e os papéis ecológicos desempenhados pelos procariotos que sustentam os ciclos biogeoquímicos relacionados ao metano. (AU)