Infraestrutura genômica para estudos da Diagonal Seca Sul-Americana: construção e curadoria de um banco de dados de mitogenomas de pequenos mamíferos

• Processo: 26/05453-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2026
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2027
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: Joyce Rodrigues Do Prado
• Beneficiário: Maria Clara Santos Ribeiro
• Instituição Sede: Museu de Zoologia (MZ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 22/12632-0 - Amostra velha é que conta história boa: a história evolutiva dos mamíferos da diagonal de vegetações abertas da América do Sul contada pelas coleções biológicas, AP.BTA.JP
• Assunto(s): Banco de dados relacionais
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Atualização contínua de banco de dados | banco de dados relacional | Curadoria de dados genômicos | Montagem e anotação de mitogenomas | Pequenos mamíferos voadores e terrestres | Zona biogeográfica | Genômica evolutiva

Resumo

O bolsista TT-IV receberá treinamento técnico e científico para processamento de dados genômicos, com posterior construção e curadoria de um banco de dados abrangente de genomas mitocondriais de, primariamente, espécies de pequenos mamíferos (Chiroptera, Didelphimorphia e Rodentia) de interesse do projeto Jovem Pesquisador da pesquisadora responsável, que se aprofunda em táxons geograficamente distribuídos na Diagonal de Vegetações Abertas da América do Sul. Ressalta-se que estas ordens concentram grande parte da diversidade de espécies de mamíferos neste complexo biogeográfico. Este trabalho contempla 121 espécies de morcegos, 26 espécies de marsupiais e 111 espécies de roedores, e, ainda, enfatiza-se que o número de espécies de morcegos que serão analisados e terão seus mitogenomas disponibilizados representa a quase totalidade dos quirópteros que compõe a Diagonal Seca (n = 129).Assim, a partir de genomas já produzidos sob coordenação da pesquisadora respondável para as espécies dos grupos mencionados, será feita a extração, montagem, anotação e curadoria de mitogenomas. Os dados serão organizados em um banco de dados relacionado, contendo informações moleculares, taxonômicas e geográficas, garantindo a reprodutibilidade e rastreabilidadade. As matrizes gênicas serão padronizadas, possibilitando a execução de análises comparativas.A Universidade de São Paulo, bem como o Museu de Zoologia, possuem um clusters adequados para o processamento bioinformático destes genomas. A disponibilidade destes dados poderão ser via plataforma já existentes, como o GenBank, que hospeda diversos tipos de dados e constitui um dos maiores bancos de dados genéticos mundiais, ou, inclusive, uma plataforma própria e dedicada aos projetos executados no MZUSP. A base de dados digital poderá servir, ainda, como uma ferramenta de extensão e popularização científica, de forma a aproximar a pesquisa do projeto Jovem Pesquisador com a comunidade geral e para fins didáticos. Adicionalmente, o bolsista participará das atividades do laboratório de mamíferos do MZUSP, atuando na curadoria dos espécimes e dados coletados durante o âmbito dessa proposta, e na iniciação de alunos de graduação às metodologias de tratamento genômico. A criação deste banco de dados resultará em uma infraestrutura genômica robusta, que servirá como base permanente para estudos de sistemática, evolução e biogeografia de pequenos mamíferos, além de integrar informações que permitirão testar hipóteses biogeográficas envolvendo as formações secas. Ainda, estas atividades irão fortalecer a qualidade analítica de pesquisas futuras desenvolvidas no laboratório de mamíferos do MZUSP. (AU)