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Otimização da técnica de microarrays de DNA visando sua aplicação no estudo da expressão gênica em tumores de próstata humanos

Processo: 01/14132-9
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Vigência (Início): 01 de fevereiro de 2002
Vigência (Término): 30 de junho de 2004
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Sergio Verjovski Almeida
Beneficiário:Giulliana Tessarin e Almeida
Instituição-sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:99/07390-0 - Cooperation for Analysis of Gene Expression - CAGE, AP.TEM
Assunto(s):Genomas   Expressão gênica   Análise de sequência com séries de oligonucleotídeos   Biomarcadores tumorais   Neoplasias da próstata   Genoma Humano do Câncer

Resumo

A comparação dos perfis de expressão gênica global de tecidos normais e malignos é uma abordagem promissora na busca por novos biomarcadores para diagnóstico, prognóstico e progressão do câncer através. Neste cenário, a tecnologia de microarrays de DNA tem sido muito empregada pois permite a análise da expressão gênica diferencial de milhares de genes simultaneamente. No projeto aqui proposto, temos como o objetivo principal otimizar a tecnologia de microarrays de cDNA para análise da expressão gênica em tumores de próstata. Para isto, fragmentos de DNA obtidos através de PCR de conjunto selecionado de ~4000 clones de cDNA humanos (clones ORESTES) derivados do Projeto Genoma do Câncer Humano foram depositados em lâminas de vidro. Estas lâminas são hibridizadas contra cDNAs marcados com fluorescência e preparados a partir de mRNA isolado de linhagens celulares tumorais e de amostras de tecido tumoral e normal de próstata humana. Esta proposta é vinculada ao subprojeto "Análise da expressão gênica em tumores de pulmão e próstata através de hibridização de microarrays" que vem sendo desenvolvido através do projeto temático intitulado "Cooperação para análise de genes e sua expressão (CAGE)". (AU)