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Construção de bibliotecas de ESTs, desenvolvimento e caracterização de marcadores SNPs (single nucleotide polymorphisms) em seringueira

Processo: 09/52104-9
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de setembro de 2009
Vigência (Término): 30 de setembro de 2010
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Agronomia - Fitotecnia
Pesquisador responsável:Anete Pereira de Souza
Beneficiário:Tatiana de Campos
Instituição-sede: Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:08/52197-4 - Genomic-assisted breeding of sugarcane: using molecular markers for understanding the genetic architecture of quantitative traits and to implement marker assisted selection, AP.BIOEN.TEM

Resumo

A seringueira (Hevea brasiliensis) é de grande importância econômica devido à produção de látex, principal matéria-prima da borracha natural. É uma planta arbórea-perene, nativa e anfidiplóide. Frente ao crescente consumo de borracha, a importância econômica da cultura e a possibilidade de exploração de material genético existente em bancos de germoplasma são necessário o desenvolvimento e a disponibilização de ferramentas moleculares que possam auxiliar programas de melhoramento. A identificação e caracterização de genes relacionados a características de importância é a maior meta na genômica funcional de plantas. Bancos de ESTs (Expressed Sequences Tag) provêm excelentes fontes de descoberta de genes e a análise da expressão destes, além da identificação de genes candidatos em fenótipos de interesse. Além disso, a construção de um banco de ESTs permite o desenvolvimento de marcadores funcionais. No contexto dos marcadores moleculares, destacam-se as vantagens dos marcadores SNPs (Singie Nucleotide Polymorphisms) devido à abundância na distribuição pelo genoma, rapidez na obtenção de resultados e a possível completa automatização da técnica. Na cultura da seringueira ainda não existem marcadores SNPs disponíveis para a aplicação em estudos genéticos. O objetivo deste projeto é construir um banco de ESTs e, desenvolver marcadores SNPs para a cultura a partir das seqüências codificantes geradas. (AU)