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Padrões de mutação em sítios de clivagem de gag e suas associações com a atividade da protease e a terapia antiviral na infecção por HIV-1

Processo: 07/04890-0
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Vigência (Início): 01 de outubro de 2007
Vigência (Término): 30 de setembro de 2009
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Ester Cerdeira Sabino
Beneficiário:Evelyn Regina de Souza Pastena
Instituição-sede: Hemocentro de São Paulo. Fundação Pró-Sangue. Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Mutação   Amplificação de genes   Produtos do gene gag   Peptídeo hidrolases   HIV-1

Resumo

O principal objetivo deste estudo é determinar a incidência e a associação das mutações nos genes gag e protease do HIV-1 buscando-se parâmetros para interpretação de variações que podem interferir na atividade catalítica da enzima protease, modificando a cinética e a infectividade viral, contribuindo para o surgimento de resistência aos inibidores de protease em um grupo bem caracterizado de indivíduos recém infectados por HIV-1 no estado de São Paulo. Serão colhidas 150 amostras de sangue em EDTA de indivíduos recém infectados por HIV-1 com base nos critérios algorítmicos STARH, estabelecidos por outros estudos. Será realizada a amplificação da região gag a partir do cDNA viral pela técnica de RT-PCR de acordo com protocolos estabelecidos em nosso laboratório. Os produtos serão sequenciados e cada seqüência será processada e analisada. As informações dos alinhamentos das seqüências, dados epidemiológicos, sócio demográficos, carga viral, contagem de células T CD4+ e resultados de genotipagem para resistência aos anti-retrovirais serão comparados e incorporados ao estudo.

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
SANABANI, SABRI SAEED; DE SOUZA PASTENA, EVELYN REGINA; KLEINE NETO, WALTER; MARTINEZ, VANESSA POUZA; SABINO, ESTER CERDEIRA. Characterization and frequency of a newly identified HIV-1 BF1 intersubtype circulating recombinant form in Sao Paulo, Brazil. VIROLOGY JOURNAL, v. 7, APR 16 2010. Citações Web of Science: 18.
SANABANI‚ S.S.; PASTENA‚ ER; NETO‚ W.K.; MARTINEZ‚ V.P.; SABINO‚ E.C.; OTHERS. Characterization and frequency of a newly identified HIV-1 BF1 intersubtype circulating recombinant form in Sao Paulo‚ Brazil. VIROLOGY JOURNAL, v. 7, p. 74, 2010.

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