Biofísica estrutural dos receptores nucleares e proteínas relacionadas
- Auxílios pontuais (curta duração)
| Processo: | 08/00078-1 |
| Linha de fomento: | Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado |
| Vigência (Início): | 01 de abril de 2008 |
| Vigência (Término): | 31 de agosto de 2010 |
| Área do conhecimento: | Ciências Biológicas - Bioquímica - Química de Macromoléculas |
| Pesquisador responsável: | Igor Polikarpov |
| Beneficiário: | Ana Carolina Migliorini Figueira |
| Instituição-sede: | Instituto de Física de São Carlos (IFSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil |
| Vinculado ao auxílio: | 06/00182-8 - Biofísica estrutural dos receptores nucleares e proteínas relacionadas, AP.TEM |
| Assunto(s): | Cristalografia de proteínas Receptores citoplasmáticos e nucleares Espalhamento de raios X a baixos ângulos Espectrometria de massas |
Resumo Os receptores nucleares (RNs) são proteínas envolvidas em importantes funções fisiológicas do organismo, sendo responsáveis pela regulação da transcrição de genes-alvo. O modo de ação dos RNs ocorre por meio de uma série de eventos sinergísticos e complexos que exigem diferentes formas de regulação, entretanto, os aspectos mecanísticos dos RNs ainda não foram bem compreendidos. Geralmente os RNs estão complexados a co-repressores, impedindo a transcrição de determinados genes. A presença do ligante induz à heterodimerização com o parceiro receptor de 9-cis retinóico (RXR) e o recrutamento de coativadores, para a indução da maquinaria transcricional. Outros receptores, chamados receptores órfãos, também podem ativar a transcrição após a complexação a coativadores sem a presença de ligantes, porém os detalhes de como esta ativação ocorrem ainda não são bem definidos. Todos esses receptores atuam ligados em elementos responsivos (HRES), localizados no DNA. Este projeto se propõe a aumentar a compreensão sobre a ação dos complexos macromoleculares formados pelos RNs, focando principalmente nas bases moleculares da sua montagem, interações e reconhecimentos. Através dos estudos de complexos formados por heterodímeros dos receptores TR e NGFI com o RXR) e dos estudos das interações destes heterodímeros com moléculas correguladoras (ALien e TRAP), além dos HRES, pretende-se estudar detalhes finos de como essas interações ocorrem. As principais técnicas a serem utilizadas neste trabalho serão SAXS e a troca de hidrogênio-deutério, seguida por espectrometria de massas, além da cristalografia de proteínas. Com essas metodologias pretende-se determinar modelos a baixas resoluções destes complexos e propor como reconhecimento entre as proteínas e proteína+DNA ocorrem. O objetivo deste projeto é o de avançar, do ponto de vista estrutural e biofísico, na busca do conhecimento funcional dos receptores nucleares, sobre os eventos de reconhecimento e complexação a proteínas correguladoras e DNA. (AU) | |