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Dinâmica molecular dos mecanismos de dissociação do hormônio estrógeno de seu receptor nuclear

Processo: 05/53931-5
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de dezembro de 2005
Vigência (Término): 10 de abril de 2008
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
Pesquisador responsável:Igor Polikarpov
Beneficiário:Milton Taidi Sonoda
Instituição-sede: Instituto de Física de São Carlos (IFSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:99/03387-4 - Estudos estruturais de proteínas usando luz síncrotron, AP.TEM
Assunto(s):Estrógenos   Receptores citoplasmáticos e nucleares   Simulação de dinâmica molecular   Isoformas de proteínas

Resumo

Receptores Nucleares (RN) são proteínas que complexam-se com regiões específicas do DNA, determinando quais genes serão expressos. A atividade dos RNs é regulada pela associação de hormônios. Pretendemos aplicar técnicas de simulação computacional por Dinâmica Molecular ao estudo dos RNs do hormônio estrógeno e suas interações com os respectivos ligantes naturais (hormônios) e análogos sintéticos, visando elucidar os mecanismos de ativação e inibição de receptores em escala atômica/molecular. Serão empregadas, de forma combinada, duas técnicas do estado da arte: a Dinâmica Molecular com Amostragem Ampliada (DMAA) e a Dinâmica Molecular com Caminho Induzido (DMCI). Com essas técnicas de simulação pretendemos encontrar os caminhos de dissociação dos ligantes da cavidade protéica e as razões da seletividade de alguns ligantes por uma das isoformas dos receptores. Inicialmente estudaremos o hormônio endógeno Estradiol, mas pretendemos extender este estudo a outros ligantes de interesse farmacológico, médico e biológico, conforme a disponibilidade de estruturas resolvidas por técnicas cristalográficas. (AU)

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