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Criação e utilização de ferramentas computacionais para suporte de projetos de Sequenciamento de DNA em larga escala

Processo: 98/13423-5
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Vigência (Início): 01 de dezembro de 1998
Vigência (Término): 31 de maio de 1999
Área do conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Teoria da Computação
Pesquisador responsável:João Carlos Setubal
Beneficiário:Renato Fonseca Furquim Werneck
Instituição-sede: Instituto de Computação (IC). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Assunto(s):Biologia computacional   Biologia molecular

Resumo

O bolsista auxiliará na resolução dos diversos problemas algorítmicos e computacionais encontrados pelo Laboratório de Bioinformática do IC-UNICAMP. Entre eles podem-se citar: montagem de fragmentos de DNA, integração entre mapeamento e montagem, e análise comparativa de genomas. Esses e outros problemas tem que ser resolvidos como parte do suporte que o LBI tem dado ao projeto de sequenciamento da bactéria Xylella fastidiosa (projeto GENOMA/FAPESP). A atividade do bolsista será diversificada, incluindo tanto a criação de programas novos quanto a utilização de programas já prontos. (AU)